Genă
TBL1X
transducin beta like 1 X-linked
- HGNC 11585↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000101849↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 6907↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- Xp22.31-p22.2
- Coordonate
- Cromozomul X: 9.465.058–9.719.740 (GRCh38)
- Exoni
- 18 de exoni pe 254,7 kb
- Proteină
- 577 de aminoacizi
- Denumiri alternative
- EBI
- Simboluri anterioare
- TBL1
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000645353.2NM_005647.4
- Tip de locus
- Care codifică proteine
- Foarte ridicată
- Ridicată
- Scăzută
- Foarte scăzută
Această pagină ca date
Adăugați .json la adresa paginii sau solicitați application/json pentru a o citi ca JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tbl1x.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameCitiți TBL1X și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRapoarte curatoriate relevante pentru această genă
Hipotiroidism congenital
O deficiență de hormoni tiroidieni prezentă de la naștere.
- 2 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
Cancer tiroidian
- Hipotiroidism
Niveluri anormal de scăzute ale hormonilor tiroidieni.
- 2 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
- Afecțiune a glandei tiroide
O boală care afectează glanda tiroidă.
- 2 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
Structura genei TBL1X
- Secvență codificatoare
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
- Situri cunoscute asociate bolilor
- Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 5,8 kb din cei 254,7 kb ai genei; 1.734 dintre aceste baze codifică proteina.
Secvențierea TBL1X
3Scăzut
Cât de greu este de secvențiat TBL1X cu citiri scurte, din 100Fiecare bară reprezintă proporția bazelor exonice ale TBL1X aflate în acest tip de regiune dificilă. Scorul le ponderează în funcție de cât de mult afectează fiecare dintre ele apelul din citiri scurte: 0 când nicio bază nu se află în nicio regiune, 100 când fiecare bază se află în toate.
- MapabilitatePorțiuni în care citirile de 100 sau 250 bp nu pot fi plasate unic, deci un apel acolo poate lipsi sau poate fi greșit. Greutate 35 %.0,8 %
- OmologieDuplicări segmentare: copii în alte părți ale genomului, precum paralogii și pseudogenele, cu o identitate de 90% sau mai mare. Greutate 30 %.0 %
- RepetițiiRepetiții în tandem și secvențe de o singură bază, pe care citirile alunecă și pe care s-ar putea să nu le acopere. Greutate 15 %.7,6 %
- Conținut GCFerestre cu sub 25% sau peste 65% G și C, zone pe care pregătirea bibliotecii le acoperă slab. Greutate 10 %.11 %
- Acoperirea referințeiGoluri în asamblarea de referință din apropiere, unde nu există nicio secvență la care citirile să se poată alinia. Greutate 10 %.0 %
2
poziții în TBL1X unde ClinVar clasifică o modificare drept patogenă sau probabil patogenă
Niciuna dintre acestea nu se află într-o regiune pe care citirile scurte o găsesc dificilă.
Un genom întreg acoperă toți cei 254,7 kb ai lui TBL1X, inclusiv intronii, nu doar cei 5,8 kb de exoni.
Gene asociate acelorași afecțiuni
- DUOX2dual oxidase 2Are 3 de afecțiuni în comun
- DUOXA2dual oxidase maturation factor 2Are 3 de afecțiuni în comun
- IGSF1immunoglobulin superfamily member 1Are 3 de afecțiuni în comun
- IRS4insulin receptor substrate 4Are 3 de afecțiuni în comun
- IYDiodotyrosine deiodinaseAre 3 de afecțiuni în comun
- NKX2-5NK2 homeobox 5Are 3 de afecțiuni în comun
- PAX8paired box 8Are 3 de afecțiuni în comun
- SECISBP2SECIS binding protein 2Are 3 de afecțiuni în comun
- SLC26A4solute carrier family 26 member 4Are 3 de afecțiuni în comun
- SLC26A7solute carrier family 26 member 7Are 3 de afecțiuni în comun
- SLC5A5solute carrier family 5 member 5Are 3 de afecțiuni în comun
- TGthyroglobulinAre 3 de afecțiuni în comun
Trăsături asociate cu TBL1X
Human Phenotype Ontology le enumeră drept caracteristici ale afecțiunilor rare pe care le poate provoca TBL1X. Pagina fiecărei trăsături enumeră celelalte gene asociate cu aceasta.
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
Proteină
De unde provin aceste date
- HGNC: simbolul genei, denumirea, celelalte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- GenCC și ClinGen, versiunea 2026-10-17: cu ce afecțiuni este asociată gena și cât de puternică este această asociere.
- Lista ACMG a rezultatelor secundare, SF v3.2.
- ClinVar și stratificările GIAB: poziții cunoscute asociate bolilor și regiunile în care citirile scurte întâmpină dificultăți.
- Stratificările genomului Genome in a Bottle, de la NIST: scorul de dificultate a secvențierii.
- Human Phenotype Ontology, versiunea 2026-09-01: trăsăturile asociate genei. Aflați mai multe la hpo.jax.org.
- Versiunea datelor 2026.10.17-8666dff2.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena TBL1X: transducin beta like 1 X-linked. Accesat 17 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/tbl1x
Dante Labs. Gena TBL1X: transducin beta like 1 X-linked [Internet]. [citat 17 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/tbl1x
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni