Gen
HSF2BP
heat shock transcription factor 2 binding protein
- HGNC 5226↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000160207↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 11077↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 21q22.3
- Koordinater
- Kromosom 21: 43 529 186–43 659 488 (GRCh38)
- Eksoner
- 9 eksoner over 130,3 kb
- Protein
- 334 aminosyrer
- Også kjent som
- MEILB2
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000291560.7NM_007031.2
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/hsf2bp.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes HSF2BP og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Infertilitet hos kvinner
Redusert eller fraværende evne hos en kvinne til å bli gravid.
- 1 GenCC-innsender vurderer den som definitiv eller sterk
Slik er HSF2BP bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 1,9 kb av genets 130,3 kb, og 1 005 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av HSF2BP
28Moderat
Hvor vanskelig HSF2BP er å sekvensere med korte leser, av 100Hver stolpe er andelen av HSF2BPs eksonbaser i den typen vanskelige regioner. Poengsummen vekter dem etter hvor mye hver enkelt koster for et kortlest-kall: 0 når ingen base er i noen, 100 når hver base er i alle.
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, så et kall der kan mangle eller være feil. Vekt 35 %.41 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vekt 30 %.41 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser glir på og kanskje ikke spenner over. Vekt 15 %.0 %
- GC-innholdVinduer under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dekker tynt. Vekt 10 %.18 %
- ReferansedekningHull i referansesammenstillingen i nærheten, der det ikke finnes noen sekvens som leser kan justeres mot. Vekt 10 %.0 %
2
posisjoner i HSF2BP der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem faller i et område som korte leser har vanskelig for å lese.
Et helt genom dekker alle 130,3 kb av HSF2BP, inkludert introner, og ikke bare de 1,9 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- ANKRD31ankyrin repeat domain 31Deler 1 tilstand
- ATMATM serine/threonine kinaseDeler 1 tilstand
- BMP15bone morphogenetic protein 15Deler 1 tilstand
- BNC1basonuclin zinc finger protein 1Deler 1 tilstand
- CLPPcaseinolytic mitochondrial matrix peptidase proteolytic subunitDeler 1 tilstand
- CYP19A1cytochrome P450 family 19 subfamily A member 1Deler 1 tilstand
- FANCMFA complementation group MDeler 1 tilstand
- FIGLAfolliculogenesis specific bHLH transcription factorDeler 1 tilstand
- FMR1fragile X messenger ribonucleoprotein 1Deler 1 tilstand
- FOXL2forkhead box L2Deler 1 tilstand
- FSHRfollicle stimulating hormone receptorDeler 1 tilstand
- GALTgalactose-1-phosphate uridylyltransferaseDeler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til HSF2BP
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene HSF2BP kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-17: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende steder, og regionene som korte leser finner vanskelige.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.18-e609d43e.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). HSF2BP-genet: heat shock transcription factor 2 binding protein. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/hsf2bp
Dante Labs. HSF2BP-genet: heat shock transcription factor 2 binding protein [Internett]. [sitert 18. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/hsf2bp
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker