Gen
SLC25A38
solute carrier family 25 member 38
- HGNC 26054↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000144659↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 54977↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 3p22.1
- Coördinaten
- Chromosoom 3: 39.383.370–39.397.351 (GRCh38)
- Exons
- 7 exons over 14 kb
- Eiwit
- 304 aminozuren
- Ook bekend als
- FLJ20551
- MANE Select-transcript
- ENST00000650617.1NM_017875.4
- Type locus
- Protein-coding
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slc25a38.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees SLC25A38 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Erfelijke sideroblastische anemieën
- Erfelijke sideroblastische anemie
Een groep aandoeningen veroorzaakt door veranderingen in genen zoals ALAS2 en ABCB7 (X-gebonden), SLC25A38, GLRX5, PUS1, YARS2 en TRNT1 (recessief) en HSPA9 (dominant); sommige vormen treffen ook de spieren, het zenuwstelsel of het immuunsysteem.
- 5 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
De X-gebonden ALAS2-vorm reageert vaak op vitamine B6 (pyridoxine), en een diagnose helpt bij het bewaken van de ijzerstapeling en onderscheidt deze aandoeningen van verworven myelodysplastisch syndroom.
Opbouw van SLC25A38
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 2,1 kb van de 14 kb van het gen; 915 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van SLC25A38
50
posities in SLC25A38 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
8 daarvan (16%) vallen in gebieden waar korte reads moeilijk zijn.
- Low mappability (8 locaties)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Een whole genome dekt alle 14 kb van SLC25A38, inclusief intronen, en niet alleen de 2,1 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ABCB7ATP binding cassette subfamily B member 7Deelt 1 aandoening
- ALAS25'-aminolevulinate synthase 2Deelt 1 aandoening
- GLRX5glutaredoxin 5Deelt 1 aandoening
- HSPA9heat shock protein family A (Hsp70) member 9Deelt 1 aandoening
- PUS1pseudouridine synthase 1Deelt 1 aandoening
- TRNT1tRNA nucleotidyl transferase 1Deelt 1 aandoening
- YARS2tyrosyl-tRNA synthetase 2Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan SLC25A38
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die SLC25A38 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-17: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). SLC25A38-gen: solute carrier family 25 member 38. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/slc25a38
Dante Labs. SLC25A38-gen: solute carrier family 25 member 38 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/slc25a38
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken