Gen
SLC25A38
solute carrier family 25 member 38
- HGNC 26054↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000144659↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 54977↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 3p22.1
- Koordinater
- Kromosom 3: 39 383 370–39 397 351 (GRCh38)
- Exoner
- 7 exoner på 14 kb
- Protein
- 304 aminosyror
- Även känd som
- FLJ20551
- MANE Select-transkript
- ENST00000650617.1NM_017875.4
- Lokustyp
- Protein-coding
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slc25a38.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs SLC25A38, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Ärftliga sideroblastanemier
- Ärftlig sideroblastanemi
En grupp tillstånd orsakade av förändringar i gener såsom ALAS2 och ABCB7 (X-bundna), SLC25A38, GLRX5, PUS1, YARS2 och TRNT1 (recessiva) samt HSPA9 (dominant); vissa former påverkar även musklerna, nervsystemet eller immunsystemet.
- 5 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
Den X-bundna ALAS2-formen svarar ofta på vitamin B6 (pyridoxin), och en diagnos vägleder uppföljningen av järnöverbelastning och skiljer dessa tillstånd från förvärvad myelodysplastisk syndrom.
Så är SLC25A38 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 2,1 kb av genens 14 kb, och 915 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av SLC25A38
50
positioner i SLC25A38 där ClinVar klassificerar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
8 av dem (16 %) ligger i regioner som korta läsningar har svårt att täcka.
- Low mappabilityRegions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely. (8 positioner)
En helgenomsekvensering täcker alla 14 kb av SLC25A38, inklusive introner, och inte bara de 2,1 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- ABCB7ATP binding cassette subfamily B member 7Delar 1 tillstånd
- ALAS25'-aminolevulinate synthase 2Delar 1 tillstånd
- GLRX5glutaredoxin 5Delar 1 tillstånd
- HSPA9heat shock protein family A (Hsp70) member 9Delar 1 tillstånd
- PUS1pseudouridine synthase 1Delar 1 tillstånd
- TRNT1tRNA nucleotidyl transferase 1Delar 1 tillstånd
- YARS2tyrosyl-tRNA synthetase 2Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till SLC25A38
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SLC25A38 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SLC25A38-genen: solute carrier family 25 member 38. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/slc25a38
Dante Labs. SLC25A38-genen: solute carrier family 25 member 38 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/slc25a38
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor