Gen
SAMD9L
sterile alpha motif domain containing 9 like
- HGNC 1349↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000177409↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 219285↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 7q21.2
- Coördinaten
- Chromosoom 7: 93.130.056–93.148.385 (GRCh38)
- Exons
- 5 exons over 18,3 kb
- Eiwit
- 1.584 aminozuren
- Ook bekend als
- KIAA2005, FLJ39885
- Eerdere symbolen
- C7orf6
- MANE Select-transcript
- ENST00000318238.9NM_152703.5
- Type locus
- Protein-coding
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/samd9l.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees SAMD9L en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Erfelijke aanleg voor myeloïde bloedkanker
- Spectrum gerelateerd aan SAMD9L en risico op myeloïde neoplasieAutosomaal dominant
SAMD9L-varianten die in verband worden gebracht met lage bloedwaarden, evenwichtsproblemen (ataxie), verlies van chromosoom 7 in het beenmerg en myelodysplastisch syndroom.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
▶Actionability
Controle van het bloedbeeld en het beenmerg.
Opbouw van SAMD9L
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 7,2 kb van de 18,3 kb van het gen; 4.755 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van SAMD9L
14
posities in SAMD9L waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een gebied waar korte reads moeilijk zijn.
Een whole genome dekt alle 18,3 kb van SAMD9L, inclusief intronen, en niet alleen de 7,2 kb aan exonen.
Kenmerken gekoppeld aan SAMD9L
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die SAMD9L kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the nervous system
- Degeneration of cerebellum
- Increased reflexes
- Abnormal gait
- Absent/small cerebellum
- Ataxia
- Unsteady walk
- Abnormal speech pattern
- Difficulty articulating speech
Toon 10 kenmerken meer
- Lack of coordination of movement
- Sensory axonal neuropathy
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Babinski sign
- Decreased sensation in extremities
- Difficulty performing quick and alternating movements
- Loss of ability to walk
- Decreased nerve conduction velocity
- Hyperactive deep tendon reflexes
- Impaired vibration sensation in the lower limbs
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-17: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). SAMD9L-gen: sterile alpha motif domain containing 9 like. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/samd9l
Dante Labs. SAMD9L-gen: sterile alpha motif domain containing 9 like [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/samd9l
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken