Gén
MYL3
myosin light chain 3
- HGNC 7584↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000160808↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 4634↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 3p21.31
- Koordináták
- 3. kromoszóma: 46 857 872–46 863 444 (GRCh38)
- Exonok
- 7 exon, összesen 5,6 kb
- Fehérje
- 195 aminosav
- Más néven ismert
- CMH8, VLC1, MLC1V, MLC1SB
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000292327.6NM_000258.3
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/myl3.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a MYL3-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Hypertrophic Cardiomyopathy
- Autoszomális domináns
A 62 hozzá kapcsolódó gén egyike
A condition in which the myocardium is hypertrophied without an obvious cause. The hypertrophy is generally asymmetric and may be associated with obstruction of the ventricular outflow tract.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
- Szerepel az ACMG másodlagos leletek listáján
▶Beavatkozhatóság
Beta-blockers, non-dihydropyridine calcium channel blockers, activity restriction, genetic counseling
A MYL3 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Oldallal rendelkező variánsok
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 5,6 kb-jából 0,9 kb-ot tesznek ki; ezek közül 588 bázis kódolja a fehérjét.
MYL3 szekvenálása
0Könnyű
Mennyire nehéz a MYL3 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A MYL3 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.
Ehhez hozzájárul: a MYL3 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 100 pontot kapna.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genomban máshol található másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.0%
- Közös a chrY-nalA pszeudoautoszomális régiók és az X-transzponált régió, ahol a chrX és a chrY azonos vagy szinte azonos szekvenciát hordoz, így az egyikről származó olvasat a másikra kerülhet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.0%
- Referencia-lefedettségA referencia-összeszerelésben a közelben lévő hiányok, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 50 pontot kapna.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló szakaszok, amelyeken az olvasatok megcsúszhatnak, és amelyeket nem biztos, hogy teljes egészükben át tudnak fogni. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 30 pontot kapna.0%
- GC-tartalom25% alatti vagy 65% feletti G- és C-tartalmú ablakok, amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 20 pontot kapna.0%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk kiMinden oszlop a MYL3 exonbázisainak azon részét mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában nehezíthet egy gént, és minden további típus egyre kevesebbet ad hozzá: 0, ha egyetlen bázis sincs ilyen régióban, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
7
a MYL3 azon pozíciói, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti a változást
Ezek közül egy sem olyan régióban van, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
A teljes genom a MYL3 mind a 5,6 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 0,9 kb exont.
Oldallal rendelkező variánsok (1)
Az itt található, oldallal rendelkező MYL3 variánsok, a legtöbb csillaggal rendelkezők először. Minden oldal a variáns ClinVar nyilvános adatbázisbeli bejegyzését írja le, sosem egy eredményt.
| Variáns | HGVS c. | Exon vagy intron | Pozíció (GRCh38) | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|---|---|
| R94H | c.281G>A | 3. exon | 46 860 702 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
ClinVar pathogenic variants (8)
The MYL3 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogén 3
- Patogén/valószínűleg patogén 1
- Valószínűleg patogén 4
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_000258.3(MYL3):c.281G>A (p.Arg94His) | cardiomyopathy and 2 others | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000258.3(MYL3):c.466G>A (p.Val156Met) (opens in a new tab) | cardiomyopathy | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000258.3(MYL3):c.466G>T (p.Val156Leu) (opens in a new tab) | hypertrophic cardiomyopathy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_000258.3(MYL3):c.445A>G (p.Met149Val) (opens in a new tab) | hypertrophic cardiomyopathy | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_000258.3(MYL3):c.157+1G>A (opens in a new tab) | hypertrophic cardiomyopathy 8 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_000258.3(MYL3):c.463C>G (p.His155Asp) (opens in a new tab) | hypertrophic cardiomyopathy 8 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_000258.3(MYL3):c.447G>T (p.Met149Ile) (opens in a new tab) | hypertrophic cardiomyopathy | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_000258.3(MYL3):c.2T>A (p.Met1Lys) (opens in a new tab) | dilated cardiomyopathy 1U | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ACADVLacyl-CoA dehydrogenase very long chain1 betegséget oszt meg
- ACTC1actin alpha cardiac muscle 11 betegséget oszt meg
- ALPK3alpha kinase 31 betegséget oszt meg
- BRAFB-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase1 betegséget oszt meg
- CDKN1Ccyclin dependent kinase inhibitor 1C1 betegséget oszt meg
- CSRP3cysteine and glycine rich protein 31 betegséget oszt meg
- DHHdesert hedgehog signaling molecule1 betegséget oszt meg
- DHX37DEAH-box helicase 371 betegséget oszt meg
- DMPKDM1 protein kinase1 betegséget oszt meg
- ERFETS2 repressor factor1 betegséget oszt meg
- ETFAelectron transfer flavoprotein subunit alpha1 betegséget oszt meg
- ETFBelectron transfer flavoprotein subunit beta1 betegséget oszt meg
A(z) MYL3 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) MYL3 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-19 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). MYL3 gén: myosin light chain 3. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/myl3
Dante Labs. MYL3 gén: myosin light chain 3 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/myl3
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt