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Gène

SIX6

SIX homeobox 6

Résumé

Localisation cytogénétique
14q23.1
Coordonnées
Chromosome 14 : 60 509 146–60 512 850 (GRCh38)
Exons
2 exons sur 3,7 kb
Protéine
246 acides aminés
Aussi appelé
Six9
Symboles précédents
OPTX2
Transcrit MANE Select
ENST00000327720.6NM_007374.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SIX6. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SIX6

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
Chromosome 14, avec un crochet à l'emplacement de SIX6. SIX6 et 10 gènes à proximité sur le chromosome 14, de 60 010 998 à 61 010 997.Chromosome 1414q23.1p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.11q32.12q32.13q32.2q32.31q32.32q32.3360,2 Mb60,4 Mb60,6 Mb60,8 Mb61 MbLRRC9 : 59 919 713–60 066 817, brin directLRRC9PCNX4 : 60 091 910–60 171 377, brin directPCNX4DHRS7 : 60 140 808–60 169 856, brin inverseDHRS7PPM1A : 60 245 752–60 299 223, brin directPPM1AC14orf39 : 60 396 469–60 515 543, brin inverseC14orf39SIX6 : 60 509 146–60 512 850, brin directSIX6SIX1 : 60 643 421–60 658 259, brin inverseSIX1SIX4 : 60 709 539–60 724 362, brin inverseSIX4MNAT1 : 60 734 733–60 973 862, brin directMNAT1TRMT5 : 60 971 441–60 981 694, brin inverseTRMT5SLC38A6 : 60 981 106–61 114 316, brin directSLC38A6Schéma de SIX6 : 2 exons sur le brin direct du chromosome 14Exon 1 : 2 sites connus associés à une maladieExon 1 : 60 509 146–60 509 970, 825 basesExon 2 : 60 511 084–60 512 850, 1 767 bases125′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,6 kb sur les 3,7 kb du gène ; 741 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit SIX6

2

positions dans SIX6 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 3,7 kb de SIX6, introns compris, et pas seulement les 2,6 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SIX6 : SIX homeobox 6. Consulté le 16 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/six6

Vancouver

Dante Labs. Gène SIX6 : SIX homeobox 6 [Internet]. [consulté le 16 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/six6

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