Gène
SEPHS1
selenophosphate synthetase 1
- HGNC 19685↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000086475↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 22929↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 10p13
- Coordonnées
- Chromosome 10 : 13 317 428–13 348 293 (GRCh38)
- Exons
- 9 exons sur 30,9 kb
- Protéine
- 392 acides aminés
- Aussi appelé
- SPS, SPS1
- Transcrit MANE Select
- ENST00000327347.10NM_012247.5
- Type de locus
- Protein-coding
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
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Structure de SEPHS1
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 3,3 kb sur les 30,9 kb du gène ; 1 179 de ces bases codent pour la protéine.
Séquençage de SEPHS1
1
position de SEPHS1 où ClinVar classe une variante comme pathogène ou probablement pathogène
1 d'entre elles (100 %) se situent dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.
- Segmental duplicationsCopies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy. (1 site)
Un génome entier couvre les 30,9 kb de SEPHS1, introns compris, et pas seulement les 3,3 kb d'exons.
Traits associés à SEPHS1
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que SEPHS1 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où viennent ces informations
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.17-8666dff2.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène SEPHS1 : selenophosphate synthetase 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/sephs1
Dante Labs. Gène SEPHS1 : selenophosphate synthetase 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/sephs1
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