Gen
SEPHS1
selenophosphate synthetase 1
- HGNC 19685↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000086475↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 22929↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 10p13
- Coördinaten
- Chromosoom 10: 13.317.428–13.348.293 (GRCh38)
- Exons
- 9 exons over 30,9 kb
- Eiwit
- 392 aminozuren
- Ook bekend als
- SPS, SPS1
- MANE Select-transcript
- ENST00000327347.10NM_012247.5
- Type locus
- Eiwitcoderend
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/sephs1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees SEPHS1 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Geen enkel Genome Test-rapport leest SEPHS1 nog. De test leest uw volledige genoom uit, dus uw gegevens bevatten het toch.
Opbouw van SEPHS1
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 3,3 kb van de 30,9 kb van het gen; 1.179 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing SEPHS1
1
positie in SEPHS1 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
1 daarvan (100%) valt in een regio die korte reads moeilijk vinden.
- Segmental duplicationsCopies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy. (1 locatie)
Een volledig genoom dekt alle 30,9 kb van SEPHS1, inclusief intronen, en niet alleen de 3,3 kb aan exonen.
ClinVar pathogenic variants (1)
The SEPHS1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen 1
| Variant | Conditions | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|
| NM_012247.5(SEPHS1):c.1112G>A (p.Arg371Gln) (opens in a new tab) | Ververi-Brady syndrome 2 | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
Kenmerken gekoppeld aan SEPHS1
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die SEPHS1 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende posities en de regio's die short reads moeilijk vinden.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.18-8b139e39.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). SEPHS1-gen: selenophosphate synthetase 1. Geraadpleegd op 19 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/sephs1
Dante Labs. SEPHS1-gen: selenophosphate synthetase 1 [Internet]. [geraadpleegd 19 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/sephs1
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken