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Gène

ICOSLG

inducible T cell costimulator ligand

Résumé

Localisation cytogénétique
21q22.3
Coordonnées
Chromosome 21 : 44 222 991–44 240 943 (GRCh38)
Exons
7 exons sur 18 kb
Protéine
302 acides aminés
Aussi appelé
KIAA0653, GL50, B7-H2, B7RP-1, B7H2, B7RP1, ICOS-L, CD275, B7h
Symboles précédents
ICOSL
Transcrit MANE Select
ENST00000407780.8NM_015259.6
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

    • Autres erreurs innées de l'immunité

      • Déficit immunitaire

        L'un des 170 gènes qui lui sont liés

        Maladie caractérisée par une déficience ou une anomalie des mécanismes de l'immunité, qu'elle soit cellulaire ou humorale.

        • ClinGen classe ce lien comme modéré
        Ce que la connaissance change

        HSCT pour le SCID et les DIP sévères ; traitement substitutif par immunoglobulines (IVIG/SCIG) pour les déficits en anticorps ; leniolisib (Joenja, FDA 2023) pour l'APDS ; thérapie génique pour l'ADA-SCID ; abatacept pour le déficit en CTLA4/LRBA ; antibioprophylaxie ; G-CSF pour la CGD

    Structure de ICOSLG

    • Séquence codante
    • Région non traduite
    • Intron
    • Sens de la transcription
    • Sites connus associés à une maladie
    • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
    Chromosome 21, avec un crochet à l'emplacement de ICOSLG. ICOSLG et 31 gènes à proximité sur le chromosome 21, de 43 731 967 à 44 731 966.Chromosome 2121q22.3p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q21.1q21.2q21.3q22.11q22.12q22.13q22.2q22.343,8 Mb44 Mb44,2 Mb44,4 Mb44,6 MbPDXK : 43 719 061–43 762 307, brin directPDXKCSTB : 43 772 511–43 776 608, brin inverseCSTBRRP1 : 43 789 513–43 821 500, brin directRRP1AGPAT3 : 43 865 081–43 987 592, brin directAGPAT3 : 43 939 919–43 959 673, brin directTRAPPC10 : 44 012 280–44 106 553, brin directTRAPPC10PWP2 : 44 107 306–44 131 181, brin directPWP2GATD3 : 44 133 610–44 210 114, brin directGATD3ICOSLG : 44 222 991–44 240 943, brin inverseICOSLGDNMT3L : 44 246 339–44 262 216, brin inverseDNMT3LAIRE : 44 285 838–44 298 648, brin directAIREPFKL : 44 300 017–44 327 377, brin directPFKLCFAP410 : 44 328 943–44 339 427, brin inverseCFAP410TRPM2 : 44 350 072–44 445 246, brin directTRPM2LRRC3 : 44 455 472–44 463 452, brin directLRRC3TSPEAR : 44 497 893–44 712 286, brin inverseKRTAP10-1 : 44 538 981–44 540 195, brin inverseKRTAP10-1KRTAP10-2 : 44 550 357–44 551 505, brin inverseKRTAP10-2KRTAP10-3 : 44 557 790–44 558 795, brin inverseKRTAP10-3KRTAP10-4 : 44 573 729–44 575 371, brin directKRTAP10-4KRTAP10-5 : 44 579 455–44 580 604, brin inverseKRTAP10-6 : 44 591 268–44 592 505, brin inverseKRTAP10-7 : 44 600 597–44 602 174, brin directKRTAP10-8 : 44 612 079–44 612 954, brin directKRTAP10-9 : 44 627 093–44 628 378, brin directKRTAP10-10 : 44 637 356–44 638 455, brin directKRTAP10-11 : 44 646 414–44 647 650, brin directKRTAP12-4 : 44 654 213–44 654 659, brin inverseKRTAP12-4KRTAP12-3 : 44 657 932–44 658 341, brin directKRTAP12-2 : 44 666 189–44 666 927, brin inverseKRTAP12-2KRTAP12-1 : 44 681 576–44 682 163, brin inverseKRTAP10-12 : 44 697 172–44 698 044, brin directSchéma de ICOSLG : 7 exons sur le brin inverse du chromosome 21Exon 4 : 1 site connu associé à une maladieExon 7 : 44 222 991–44 229 044, 6 054 basesExon 6 : 44 230 054–44 230 089, 36 basesExon 5 : 44 231 280–44 231 444, 165 basesExon 4 : 44 235 272–44 235 562, 291 basesExon 3 : 44 236 867–44 237 217, 351 basesExon 2 : 44 238 448–44 238 488, 41 basesExon 1 : 44 240 804–44 240 943, 140 bases76543215′3′

    Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

    Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

    Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

    Les exons représentent 7,1 kb sur les 18 kb du gène ; 909 de ces bases codent pour la protéine.

    Comment un test génomique lit ICOSLG

    2

    positions dans ICOSLG où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

    2 d'entre elles (100 %) se situent dans des régions que les lectures courtes peinent à analyser.

    • Low mappability (2 sites)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
    • Segmental duplications (2 sites)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

    Un génome entier couvre les 18 kb de ICOSLG, introns compris, et pas seulement les 7,1 kb d'exons.

    D'où viennent ces informations

    • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
    • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
    • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
    • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
    • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
    • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
    • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

    Citer cette page

    APA

    Dante Labs. (s.d.). Gène ICOSLG : inducible T cell costimulator ligand. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/icoslg

    Vancouver

    Dante Labs. Gène ICOSLG : inducible T cell costimulator ligand [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/icoslg

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