Geeni
NPC2
NPC intracellular cholesterol transporter 2
- HGNC 14537↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000119655↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 10577↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 14q24.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 14: 74 479 940–74 493 305 (GRCh38)
- Eksonit
- 5 eksonia 13,4 kb:n alueella
- Proteiini
- 151 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- HE1, NP-C2, EDDM1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000555619.6NM_006432.5
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Lue NPC2 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Niemann-Pickin tauti tyyppi C
- Autosomaalinen resessiivinen
NPC on monimutkainen lipidien kertymissairaus, jolle on pääasiallisesti tunnusomaista vapaan kolesterolin kertyminen myöhäisen endosomaalisen/lysosomaalisen osaston sisään.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 8 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
NPC: miglustaatti (Zavesca, EU-hyväksyntä); arimoklomidi (kliinisissä tutkimuksissa); tyypit A/B: olipudaasi alfa (Xenpozyme, hyväksytty vuonna 2022 ei-neurologisiin oireisiin); tukihoito; miglustaattia voidaan harkita ennen molekyylidiagnoosin vahvistamista diagnostisen vaikeuden vuoksi
Laajemmat ryhmät
Lysosomaalinen varastosairaus
- Lysosomaalinen kertymäsairaus (muut ja määrittelemättömät tyypit)
Yksi 59 siihen liittyvästä geenistä
Kattaa lysosomaaliset kertymäsairaudet, joilla ei ole omaa raporttia, kuten Farberin tauti ja muut ASAH1-geeniin liittyvät sairaudet, prosapsiini- (PSAP) -puutokset, multippeli sulfataasipuutos, mukopolysakkaridoosi tyypit IX ja X sekä Dorfman-Chanarinin tauti. Periytymistapa vaihtelee alatyypeittäin, useimmiten autosomaalisesti resessiivinen.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 8 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
NPC2-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 0,8 kb geenin 13,4 kb:stä; 456 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä NPC2
53
NPC2-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 13,4 kb geenistä NPC2, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 0,8 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- NPC1NPC intracellular cholesterol transporter 1Yhteisiä sairauksia: 2
- ABHD5abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferaseYhteinen sairaus: 1
- AGAaspartylglucosaminidaseYhteinen sairaus: 1
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Yhteinen sairaus: 1
- ARSAarylsulfatase AYhteinen sairaus: 1
- ARSBarylsulfatase BYhteinen sairaus: 1
- ARSKarylsulfatase family member KYhteinen sairaus: 1
- ASAH1N-acylsphingosine amidohydrolase 1Yhteinen sairaus: 1
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 6Yhteinen sairaus: 1
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, batteninYhteinen sairaus: 1
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthaseYhteinen sairaus: 1
- CLN6CLN6 transmembrane ER proteinYhteinen sairaus: 1
Geeniin NPC2 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita NPC2 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). NPC2-geeni: NPC intracellular cholesterol transporter 2. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/npc2
Dante Labs. NPC2-geeni: NPC intracellular cholesterol transporter 2 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/npc2
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa