Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

SLCO1B1

solute carrier organic anion transporter family member 1B1

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
12p12.1
Koordinaadid
Kromosoom 12: 21 131 194–21 239 796 (GRCh38)
Eksonid
15 eksonit, ulatus 108,6 kb
Valk
691 aminohapet
Tuntud ka kui
OATP-C, LST-1, OATP1B1
Varasemad tähised
SLC21A6
MANE Select transkript
ENST00000256958.3NM_006446.5
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

SLCO1B1 ja ravimid

Kuidas SLCO1B1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 12, millel on sulg kohal, kus asub SLCO1B1. SLCO1B1 ja sellele lähedal asuvad 14 geeni kromosoomil 12, vahemikus 20 685 495 kuni 21 685 494.Kromosoom 1212p12.1p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3320,8 Mb21 Mb21,2 Mb21,4 Mb21,6 MbPDE3A: 20 368 322–20 688 583, otsene ahelPDE3ASLCO1C1: 20 695 332–20 753 386, otsene ahelSLCO1C1SLCO1B3: 20 806 645–20 918 230, otsene ahelSLCO1B3SLCO1B3-SLCO1B7: 20 815 674–21 090 245, otsene ahelSLCO1B3-SLCO1B7: 21 047 179–21 176 895, otsene ahelSLCO1B1: 21 131 194–21 239 796, otsene ahelSLCO1B1SLCO1A2: 21 264 600–21 419 676, pöördne ahelSLCO1A2IAPP: 21 354 959–21 379 980, otsene ahelIAPPPYROXD1: 21 437 591–21 471 250, otsene ahelPYROXD1RECQL: 21 464 720–21 501 669, pöördne ahelRECQLGOLT1B: 21 501 781–21 518 408, otsene ahelGOLT1BSPX: 21 526 296–21 541 249, otsene ahelSPXGYS2: 21 531 545–21 604 951, pöördne ahelGYS2: 21 536 203–21 657 798, pöördne ahelLDHB: 21 635 339–21 757 890, pöördne ahelLDHBSLCO1B1 skeem: 15 eksonit kromosoomi 12 otsene ahelalEkson 8: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 9: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 12: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 13: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 1: 21 131 194–21 131 236, 43 alustEkson 2: 21 141 514–21 141 658, 145 alustEkson 3: 21 172 650–21 172 791, 142 alustEkson 4: 21 174 577–21 174 709, 133 alustEkson 5: 21 176 776–21 176 897, 122 alustEkson 6: 21 178 576–21 178 722, 147 alustEkson 7: 21 178 922–21 179 020, 99 alustEkson 8: 21 196 946–21 197 188, 243 alustEkson 9: 21 200 508–21 200 672, 165 alustEkson 10: 21 202 491–21 202 686, 196 alustEkson 11: 21 205 868–21 206 033, 166 alustEkson 12: 21 217 119–21 217 303, 185 alustEkson 13: 21 222 300–21 222 364, 65 alustEkson 14: 21 224 722–21 224 839, 118 alustEkson 15: 21 238 979–21 239 796, 818 alust12468101214155′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 2,8 kb kogupikkusega 108,6 kb; neist 2076 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse SLCO1B1

6

kohad geenis SLCO1B1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni SLCO1B1 108,6 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (2,8 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • CPIC ja PharmGKB: alleelid, tulemused ja ravimid.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). SLCO1B1 geen: solute carrier organic anion transporter family member 1B1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/slco1b1

Vancouver

Dante Labs. SLCO1B1 geen: solute carrier organic anion transporter family member 1B1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/slco1b1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test