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Gène

SLCO1B1

solute carrier organic anion transporter family member 1B1

Résumé

Localisation cytogénétique
12p12.1
Coordonnées
Chromosome 12 : 21 131 194–21 239 796 (GRCh38)
Exons
15 exons sur 108,6 kb
Protéine
691 acides aminés
Aussi appelé
OATP-C, LST-1, OATP1B1
Symboles précédents
SLC21A6
Transcrit MANE Select
ENST00000256958.3NM_006446.5
Type de locus
Protein-coding
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

SLCO1B1 et médicaments

  • Risque de myopathie sous statines

    Pharmacogénomique

    SLCO1B1 assure le transport des statines vers le foie. Les allèles à fonction réduite augmentent les concentrations sanguines de statines et le risque d'effets secondaires musculaires — un effet particulièrement marqué avec la simvastatin, mais pour lequel le CPIC émet également des recommandations concernant l'atorvastatin, la fluvastatin, la lovastatin, la pitavastatin, la pravastatin et la rosuvastatin.

    • Si vous prenez ou débutez une statine et ressentez des douleurs musculaires, signalez ce résultat à votre médecin.
    • Le risque est maximal avec la simvastatin. Le CPIC définit des limites de dose pour chaque statine ; une posologie plus faible ou une autre molécule suffisent généralement.

    Allèles lus par le rapport

    • *5No function
    • *1Normal function

    Résultats décrits par CPIC

    • Possible Decreased Function
    • Decreased Function
    • Increased Function
    • Indeterminate
    • Normal Function
    • Poor Function
    MédicamentNiveau CPICRecommandation
    atorvastatinASLCO1B1, ABCG2, CYP2C9, and Statins
    fluvastatinASLCO1B1, ABCG2, CYP2C9, and Statins
    lovastatinASLCO1B1, ABCG2, CYP2C9, and Statins
    pitavastatinASLCO1B1, ABCG2, CYP2C9, and Statins
    pravastatinASLCO1B1, ABCG2, CYP2C9, and Statins
    rosuvastatinASLCO1B1, ABCG2, CYP2C9, and Statins
    simvastatinASLCO1B1, ABCG2, CYP2C9, and Statins
    Afficher 2 médicaments de plus
    MédicamentNiveau CPICRecommandation
    elagolixB/C
    methotrexateC

Structure de SLCO1B1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 12, avec un crochet à l'emplacement de SLCO1B1. SLCO1B1 et 14 gènes à proximité sur le chromosome 12, de 20 685 495 à 21 685 494.Chromosome 1212p12.1p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3320,8 Mb21 Mb21,2 Mb21,4 Mb21,6 MbPDE3A : 20 368 322–20 688 583, brin directPDE3ASLCO1C1 : 20 695 332–20 753 386, brin directSLCO1C1SLCO1B3 : 20 806 645–20 918 230, brin directSLCO1B3SLCO1B3-SLCO1B7 : 20 815 674–21 090 245, brin directSLCO1B3-SLCO1B7 : 21 047 179–21 176 895, brin directSLCO1B1 : 21 131 194–21 239 796, brin directSLCO1B1SLCO1A2 : 21 264 600–21 419 676, brin inverseSLCO1A2IAPP : 21 354 959–21 379 980, brin directIAPPPYROXD1 : 21 437 591–21 471 250, brin directPYROXD1RECQL : 21 464 720–21 501 669, brin inverseRECQLGOLT1B : 21 501 781–21 518 408, brin directGOLT1BSPX : 21 526 296–21 541 249, brin directSPXGYS2 : 21 531 545–21 604 951, brin inverseGYS2 : 21 536 203–21 657 798, brin inverseLDHB : 21 635 339–21 757 890, brin inverseLDHBSchéma de SLCO1B1 : 15 exons sur le brin direct du chromosome 12Exon 8 : 1 site connu associé à une maladieExon 9 : 1 site connu associé à une maladieExon 12 : 1 site connu associé à une maladieExon 13 : 1 site connu associé à une maladieExon 1 : 21 131 194–21 131 236, 43 basesExon 2 : 21 141 514–21 141 658, 145 basesExon 3 : 21 172 650–21 172 791, 142 basesExon 4 : 21 174 577–21 174 709, 133 basesExon 5 : 21 176 776–21 176 897, 122 basesExon 6 : 21 178 576–21 178 722, 147 basesExon 7 : 21 178 922–21 179 020, 99 basesExon 8 : 21 196 946–21 197 188, 243 basesExon 9 : 21 200 508–21 200 672, 165 basesExon 10 : 21 202 491–21 202 686, 196 basesExon 11 : 21 205 868–21 206 033, 166 basesExon 12 : 21 217 119–21 217 303, 185 basesExon 13 : 21 222 300–21 222 364, 65 basesExon 14 : 21 224 722–21 224 839, 118 basesExon 15 : 21 238 979–21 239 796, 818 bases12468101214155′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,8 kb sur les 108,6 kb du gène ; 2 076 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de SLCO1B1

6

positions de SLCO1B1 où ClinVar classe une variante comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 108,6 kb de SLCO1B1, introns compris, et pas seulement les 2,8 kb d'exons.

Traits associés à SLCO1B1

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que SLCO1B1 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • CPIC et PharmGKB : les allèles, les résultats et les médicaments.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.17-8666dff2.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SLCO1B1 : solute carrier organic anion transporter family member 1B1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/slco1b1

Vancouver

Dante Labs. Gène SLCO1B1 : solute carrier organic anion transporter family member 1B1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/slco1b1

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