Ga naar de inhoud
Gebruik uw HSA- of FSA-tegoed
Laat uw genoom in kaart brengen (opent in een nieuw tabblad)

Gen

SLCO1B1

solute carrier organic anion transporter family member 1B1

Samenvatting

Cytogenetische locatie
12p12.1
Coördinaten
Chromosoom 12: 21.131.194–21.239.796 (GRCh38)
Exons
15 exons over 108,6 kb
Eiwit
691 aminozuren
Ook bekend als
OATP-C, LST-1, OATP1B1
Eerdere symbolen
SLC21A6
MANE Select-transcript
ENST00000256958.3NM_006446.5
Type locus
Protein-coding
  • Zeer hoog
  • Betrouwbaar
  • Laag
  • Zeer laag

SLCO1B1 en medicijnen

Opbouw van SLCO1B1

  • Coderende sequentie
  • Niet-vertaald gebied
  • Intron
  • Richting van transcriptie
  • Bekende ziekteveroorzakende posities
  • Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Chromosoom 12, met een haakje waar SLCO1B1 zich bevindt. SLCO1B1 en 14 genen in de buurt op chromosoom 12, van 20.685.495 tot 21.685.494.Chromosoom 1212p12.1p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3320,8 Mb21 Mb21,2 Mb21,4 Mb21,6 MbPDE3A: 20.368.322–20.688.583, voorwaartse-strengPDE3ASLCO1C1: 20.695.332–20.753.386, voorwaartse-strengSLCO1C1SLCO1B3: 20.806.645–20.918.230, voorwaartse-strengSLCO1B3SLCO1B3-SLCO1B7: 20.815.674–21.090.245, voorwaartse-strengSLCO1B3-SLCO1B7: 21.047.179–21.176.895, voorwaartse-strengSLCO1B1: 21.131.194–21.239.796, voorwaartse-strengSLCO1B1SLCO1A2: 21.264.600–21.419.676, omgekeerde-strengSLCO1A2IAPP: 21.354.959–21.379.980, voorwaartse-strengIAPPPYROXD1: 21.437.591–21.471.250, voorwaartse-strengPYROXD1RECQL: 21.464.720–21.501.669, omgekeerde-strengRECQLGOLT1B: 21.501.781–21.518.408, voorwaartse-strengGOLT1BSPX: 21.526.296–21.541.249, voorwaartse-strengSPXGYS2: 21.531.545–21.604.951, omgekeerde-strengGYS2: 21.536.203–21.657.798, omgekeerde-strengLDHB: 21.635.339–21.757.890, omgekeerde-strengLDHBDiagram van SLCO1B1: 15 exons op de voorwaartse streng van chromosoom 12Exon 8: 1 bekende ziekteveroorzakende positieExon 9: 1 bekende ziekteveroorzakende positieExon 12: 1 bekende ziekteveroorzakende positieExon 13: 1 bekende ziekteveroorzakende positieExon 1: 21.131.194–21.131.236, 43 basenExon 2: 21.141.514–21.141.658, 145 basenExon 3: 21.172.650–21.172.791, 142 basenExon 4: 21.174.577–21.174.709, 133 basenExon 5: 21.176.776–21.176.897, 122 basenExon 6: 21.178.576–21.178.722, 147 basenExon 7: 21.178.922–21.179.020, 99 basenExon 8: 21.196.946–21.197.188, 243 basenExon 9: 21.200.508–21.200.672, 165 basenExon 10: 21.202.491–21.202.686, 196 basenExon 11: 21.205.868–21.206.033, 166 basenExon 12: 21.217.119–21.217.303, 185 basenExon 13: 21.222.300–21.222.364, 65 basenExon 14: 21.224.722–21.224.839, 118 basenExon 15: 21.238.979–21.239.796, 818 basen12468101214155′3′

Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.

Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).

Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.

Exonen vormen 2,8 kb van de 108,6 kb van het gen; 2.076 van die basen coderen voor het eiwit.

Sequencing van SLCO1B1

6

posities in SLCO1B1 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt

Geen daarvan valt in een gebied waar korte reads moeilijk zijn.

Een whole genome dekt alle 108,6 kb van SLCO1B1, inclusief intronen, en niet alleen de 2,8 kb aan exonen.

Kenmerken gekoppeld aan SLCO1B1

De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die SLCO1B1 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.

Externe links

Waar dit vandaan komt

  • HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
  • MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
  • ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
  • CPIC en PharmGKB: de allelen, resultaten en geneesmiddelen.
  • De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
  • Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.

Deze pagina citeren

APA

Dante Labs. (z.d.). SLCO1B1-gen: solute carrier organic anion transporter family member 1B1. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/slco1b1

Vancouver

Dante Labs. SLCO1B1-gen: solute carrier organic anion transporter family member 1B1 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/slco1b1

Eén test. Een leven lang antwoorden.

Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken

Mijn Genome Test bestellen