Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

GATA5

GATA binding protein 5

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
20q13.33
Koordinaadid
Kromosoom 20: 62 463 497–62 475 995 (GRCh38)
Eksonid
7 eksonit, ulatus 12,5 kb
Valk
397 aminohapet
Tuntud ka kui
bB379O24.1, GATAS
MANE Select transkript
ENST00000252997.3NM_080473.5
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni GATA5 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas GATA5 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 20, millel on sulg kohal, kus asub GATA5. GATA5 ja sellele lähedal asuvad 21 geeni kromosoomil 20, vahemikus 61 969 746 kuni 62 969 745.Kromosoom 2020q13.33p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3362 Mb62,2 Mb62,4 Mb62,6 Mb62,8 MbTAF4: 61 953 469–62 065 881, pöördne ahelTAF4LSM14B: 62 122 417–62 136 728, otsene ahelLSM14BPSMA7: 62 136 725–62 143 470, pöördne ahelPSMA7SS18L1: 62 143 606–62 182 514, otsene ahelSS18L1MTG2: 62 183 005–62 203 571, otsene ahelMTG2HRH3: 62 214 960–62 220 303, pöördne ahelHRH3OSBPL2: 62 231 922–62 296 213, otsene ahelOSBPL2ADRM1: 62 302 046–62 308 867, otsene ahelADRM1LAMA5: 62 307 955–62 367 333, pöördne ahelLAMA5RPS21: 62 365 598–62 388 680, otsene ahelRPS21CABLES2: 62 388 630–62 407 319, pöördne ahelCABLES2RBBP8NL: 62 410 143–62 427 548, pöördne ahelRBBP8NLGATA5: 62 463 497–62 475 995, pöördne ahelGATA5SLCO4A1: 62 642 440–62 685 785, otsene ahelSLCO4A1NTSR1: 62 708 427–62 762 771, otsene ahelNTSR1MRGBP: 62 796 452–62 801 729, otsene ahelMRGBPOGFR: 62 804 178–62 814 000, otsene ahelOGFRCOL9A3: 62 816 244–62 841 164, otsene ahelCOL9A3TCFL5: 62 840 997–62 861 840, pöördne ahelTCFL5DIDO1: 62 877 738–62 937 992, pöördne ahelDIDO1GID8: 62 937 060–62 948 589, otsene ahelGID8SLC17A9: 62 952 645–62 969 588, otsene ahelSLC17A9GATA5 skeem: 7 eksonit kromosoomi 20 pöördne ahelalEkson 7: 62 463 497–62 464 991, 1495 alustEkson 6: 62 465 340–62 465 464, 125 alustEkson 5: 62 465 834–62 465 921, 88 alustEkson 4: 62 466 426–62 466 551, 126 alustEkson 3: 62 473 403–62 473 578, 176 alustEkson 2: 62 474 999–62 475 542, 544 alustEkson 1: 62 475 930–62 475 995, 66 alust76543215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 2,6 kb kogupikkusega 12,5 kb; neist 1194 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse GATA5

1

koht geenis GATA5, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni GATA5 12,5 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (2,6 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). GATA5 geen: GATA binding protein 5. Vaadatud 16. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/gata5

Vancouver

Dante Labs. GATA5 geen: GATA binding protein 5 [Internet]. [viidatud 16. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/gata5

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test