Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi

Geeni

GATA5

GATA binding protein 5

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
20q13.33
Koordinaatit
Kromosomi 20: 62 463 497–62 475 995 (GRCh38)
Eksonit
7 eksonia 12,5 kb:n alueella
Proteiini
397 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
bB379O24.1, GATAS
MANE Select -transkripti
ENST00000252997.3NM_080473.5
Lokustyyppi
gene with protein product
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

ViitegenomiGRCh38

Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä GATA5. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

GATA5-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 20, jossa hakasulke osoittaa GATA5-geenin sijainnin. GATA5 ja 21 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 20, välillä 61 969 746–62 969 745.Kromosomi 2020q13.33p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3362 Mb62,2 Mb62,4 Mb62,6 Mb62,8 MbTAF4: 61 953 469–62 065 881, juoste taaksepäinTAF4LSM14B: 62 122 417–62 136 728, juoste eteenpäinLSM14BPSMA7: 62 136 725–62 143 470, juoste taaksepäinPSMA7SS18L1: 62 143 606–62 182 514, juoste eteenpäinSS18L1MTG2: 62 183 005–62 203 571, juoste eteenpäinMTG2HRH3: 62 214 960–62 220 303, juoste taaksepäinHRH3OSBPL2: 62 231 922–62 296 213, juoste eteenpäinOSBPL2ADRM1: 62 302 046–62 308 867, juoste eteenpäinADRM1LAMA5: 62 307 955–62 367 333, juoste taaksepäinLAMA5RPS21: 62 365 598–62 388 680, juoste eteenpäinRPS21CABLES2: 62 388 630–62 407 319, juoste taaksepäinCABLES2RBBP8NL: 62 410 143–62 427 548, juoste taaksepäinRBBP8NLGATA5: 62 463 497–62 475 995, juoste taaksepäinGATA5SLCO4A1: 62 642 440–62 685 785, juoste eteenpäinSLCO4A1NTSR1: 62 708 427–62 762 771, juoste eteenpäinNTSR1MRGBP: 62 796 452–62 801 729, juoste eteenpäinMRGBPOGFR: 62 804 178–62 814 000, juoste eteenpäinOGFRCOL9A3: 62 816 244–62 841 164, juoste eteenpäinCOL9A3TCFL5: 62 840 997–62 861 840, juoste taaksepäinTCFL5DIDO1: 62 877 738–62 937 992, juoste taaksepäinDIDO1GID8: 62 937 060–62 948 589, juoste eteenpäinGID8SLC17A9: 62 952 645–62 969 588, juoste eteenpäinSLC17A9GATA5-kaavio: 7 eksonia kromosomin 20 juosteella, taaksepäinEkson 7: 62 463 497–62 464 991, 1 495 emästäEkson 6: 62 465 340–62 465 464, 125 emästäEkson 5: 62 465 834–62 465 921, 88 emästäEkson 4: 62 466 426–62 466 551, 126 emästäEkson 3: 62 473 403–62 473 578, 176 emästäEkson 2: 62 474 999–62 475 542, 544 emästäEkson 1: 62 475 930–62 475 995, 66 emästä76543215′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 2,6 kb geenin 12,5 kb:stä; 1 194 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Miten genomitesti lukee geeniä GATA5

1

GATA5-geenin kohta, jossa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi

Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.

Kokogenomi kattaa kaikki 12,5 kb geenistä GATA5, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 2,6 kb eksoneja.

Mistä tieto on peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
  • Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
  • Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). GATA5-geeni: GATA binding protein 5. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/gata5

Vancouver

Dante Labs. GATA5-geeni: GATA binding protein 5 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/gata5

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test