Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel

Gen

GATA5

GATA binding protein 5

Sammanfattning

Cytogenetisk position
20q13.33
Koordinater
Kromosom 20: 62 463 497–62 475 995 (GRCh38)
Exoner
7 exoner på 12,5 kb
Protein
397 aminosyror
Även känd som
bB379O24.1, GATAS
MANE Select-transkript
ENST00000252997.3NM_080473.5
Lokustyp
gene with protein product
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

ReferensgenomGRCh38

Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser GATA5 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är GATA5 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 20, med en parentes där GATA5 finns. GATA5 och 21 gener i närheten på kromosom 20, från 61 969 746 till 62 969 745.Kromosom 2020q13.33p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3362 Mb62,2 Mb62,4 Mb62,6 Mb62,8 MbTAF4: 61 953 469–62 065 881, bakåt-strängTAF4LSM14B: 62 122 417–62 136 728, framåt-strängLSM14BPSMA7: 62 136 725–62 143 470, bakåt-strängPSMA7SS18L1: 62 143 606–62 182 514, framåt-strängSS18L1MTG2: 62 183 005–62 203 571, framåt-strängMTG2HRH3: 62 214 960–62 220 303, bakåt-strängHRH3OSBPL2: 62 231 922–62 296 213, framåt-strängOSBPL2ADRM1: 62 302 046–62 308 867, framåt-strängADRM1LAMA5: 62 307 955–62 367 333, bakåt-strängLAMA5RPS21: 62 365 598–62 388 680, framåt-strängRPS21CABLES2: 62 388 630–62 407 319, bakåt-strängCABLES2RBBP8NL: 62 410 143–62 427 548, bakåt-strängRBBP8NLGATA5: 62 463 497–62 475 995, bakåt-strängGATA5SLCO4A1: 62 642 440–62 685 785, framåt-strängSLCO4A1NTSR1: 62 708 427–62 762 771, framåt-strängNTSR1MRGBP: 62 796 452–62 801 729, framåt-strängMRGBPOGFR: 62 804 178–62 814 000, framåt-strängOGFRCOL9A3: 62 816 244–62 841 164, framåt-strängCOL9A3TCFL5: 62 840 997–62 861 840, bakåt-strängTCFL5DIDO1: 62 877 738–62 937 992, bakåt-strängDIDO1GID8: 62 937 060–62 948 589, framåt-strängGID8SLC17A9: 62 952 645–62 969 588, framåt-strängSLC17A9Diagram över GATA5: 7 exoner på bakåt-strängen av kromosom 20Exon 7: 62 463 497–62 464 991, 1 495 baserExon 6: 62 465 340–62 465 464, 125 baserExon 5: 62 465 834–62 465 921, 88 baserExon 4: 62 466 426–62 466 551, 126 baserExon 3: 62 473 403–62 473 578, 176 baserExon 2: 62 474 999–62 475 542, 544 baserExon 1: 62 475 930–62 475 995, 66 baser76543215′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 2,6 kb av genens 12,5 kb, och 1 194 av dessa baser kodar för proteinet.

Så läser ett genomtest GATA5

1

position i GATA5 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen

Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.

En helgenomsanalys täcker alla 12,5 kb av GATA5, med introner inräknade, inte bara de 2,6 kb exoner.

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
  • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
  • Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). GATA5-genen: GATA binding protein 5. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/gata5

Vancouver

Dante Labs. GATA5-genen: GATA binding protein 5 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/gata5

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test