Geen
CPS1
carbamoyl-phosphate synthase 1
- HGNC 2323↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000021826↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 1373↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 2q34
- Koordinaadid
- Kromosoom 2: 210 556 599–210 679 107 (GRCh38)
- Eksonid
- 38 eksonit, ulatus 122,5 kb
- Valk
- 1500 aminohapet
- Tuntud ka kui
- GATD6
- MANE Select transkript
- ENST00000233072.10NM_001875.5
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe CPS1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Ureatsükli häire
Geneetiline kaasasündinud ainevahetushäire, mida iseloomustab ühe ureatsükli jaoks vajaliku ensüümi puudulikkus. Selle tulemusena koguneb organismis ammoniaak.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 5 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Lämmastikku siduv ravi (naatriumbensoaat, glütseroolfenüülbutüraat/Ravicti); valgupiiranguga dieet koos asendamatute aminohapete lisamisega; hüperammonemia erakorralised protokollid; maksasiire (ravib haigust); OTC puhul mRNA-ravi uuringud; NAGS-puudulikkuse korral karglumiinhape
Kuidas CPS1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 5,8 kb kogupikkusega 122,5 kb; neist 4503 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse CPS1
395
kohad geenis CPS1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni CPS1 122,5 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (5,8 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- ARG1arginase 1Jagab 1 haigust
- ASLargininosuccinate lyaseJagab 1 haigust
- ASS1argininosuccinate synthase 1Jagab 1 haigust
- CA5Acarbonic anhydrase 5AJagab 1 haigust
- GLUD1glutamate dehydrogenase 1Jagab 1 haigust
- MCCC1methylcrotonyl-CoA carboxylase subunit 1Jagab 1 haigust
- NAGSN-acetylglutamate synthaseJagab 1 haigust
- OTCornithine transcarbamylaseJagab 1 haigust
- SLC25A13solute carrier family 25 member 13Jagab 1 haigust
- SLC25A15solute carrier family 25 member 15Jagab 1 haigust
Geeniga CPS1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida CPS1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). CPS1 geen: carbamoyl-phosphate synthase 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/cps1
Dante Labs. CPS1 geen: carbamoyl-phosphate synthase 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/cps1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast