Gen
TRDN
triadin
- HGNC 12261↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000186439↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 10345↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 6q22.31
- Koordinater
- Kromosom 6: 123.216.339–123.636.950 (GRCh38)
- Exoner
- 41 exoner fordelt over 420,6 kb
- Protein
- 729 aminosyrer
- Også kendt som
- TRISK
- MANE Select-transkript
- ENST00000334268.9NM_006073.4
- Lokustype
- Proteinkodende
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/trdn.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs TRDN og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Katekolaminerget polymorf ventrikulær takykardi
- Familiær ventrikulær takykardi
Et tilfælde af ventrikulær takykardi, som skyldes en arvelig ændring i personens genom.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 5 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
- På ACMG's liste over sekundære fund
- Polymorf ventrikulær takykardi
En ventrikulær takykardi med uregelmæssig frekvens og rytme.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 5 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
- På ACMG's liste over sekundære fund
Long QT-syndrom
En forstyrrelse af hjertets repolarisering, kendetegnet ved et forlænget QT-interval og en risiko for farlige ventrikulære arytmier, såsom torsades de pointes.
- ClinGen vurderer forbindelsen som stærk
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
- På ACMG's liste over sekundære fund
▶Handlingsrelevans
Betablokkere, ICD-implantation, aktivitetsbegrænsning, genetisk rådgivning
Sådan er TRDN opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
- Varianter med en side
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 4,6 kb af genets 420,6 kb; 2.190 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af TRDN
2Let
Hvor svær TRDN er at sekventere med korte reads, ud af 100
0 · Let100 · Svær
Næsten alle eksonerne i TRDN ligger, hvor korte reads kan kortlægges tydeligt.
Det, der lægger til: andelen af eksonerne i TRDN i hver type svær region
- KortlægningsbarhedStrækninger, hvor reads på 100 eller 250 bp ikke kan placeres entydigt, så et kald dér kan mangle eller være forkert. Vægt 35 %.0 %
- HomologiSegmentale duplikationer: kopier andre steder i genomet, fx paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mere. Vægt 30 %.0 %
- GentagelserTandem-gentagelser og serier af én base, som reads glider på og måske ikke kan spænde over. Vægt 15 %.5,3 %
- GC-indholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dækker tyndt. Vægt 10 %.16 %
- ReferencedækningHuller i den nærliggende referencesamling, hvor der ikke findes nogen sekvens, som reads kan tilpasses til. Vægt 10 %.0 %
En Dante Labs-score baseret på vores egen forskning, bygget på NIST's Genome in a Bottle-kort over svært sekventerbare regioner.Sådan beregnes scorenHver søjle er andelen af eksonbaserne i TRDN i den pågældende type svær region. Scoren vægter dem efter, hvor meget hver koster et kald med korte reads: 0, når ingen base ligger i nogen, 100, når alle baser ligger i alle.
52
positioner i TRDN, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem falder i et område, som korte reads har svært ved at finde.
Et helt genom dækker alle 420,6 kb af TRDN, inklusive introner, og ikke kun de 4,6 kb eksoner.
Varianter med en side (8)
Her vises de TRDN-varianter med en side, med de flest anmeldelsesstjerner først. Hver side beskriver ClinVars offentlige registrering af varianten, aldrig et resultat.
| Variant | HGVS c. | Exon eller intron | Position (GRCh38) | ClinVar-klassifikation | Gennemgangsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| c.22+29A>G | Intron 1 | 123.636.725 | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter | |
| c.391+1G>A | Intron 3 | 123.548.453 | Sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter | |
| c.550+1_550+2insA | Intron 6 | 123.516.139 | Sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter | |
| D18Afs*14 | c.53_56del | Exon 2 | 123.571.098 | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| E168X | c.502G>T | Exon 6 | 123.516.189 | Patogen/sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| E178Kfs*45 | c.531del | Exon 6 | 123.516.159 | Patogen/sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| Q205X | c.613C>T | Exon 8 | 123.503.899 | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| V162Lfs*13 | c.483del | Exon 5 | 123.530.506 | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
ClinVar pathogenic variants (55)
The TRDN variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 30
- Patogen/sandsynligvis patogen 2
- Sandsynligvis patogen 23
| Variant | Conditions | ClinVar-klassifikation | Gennemgangsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_006073.4(TRDN):c.613C>T (p.Gln205Ter) | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia and 2 others | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_006073.4(TRDN):c.483del (p.Val162fs) | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 1 and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_006073.4(TRDN):c.53_56del (p.Asp18fs) | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 1 and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_006073.4(TRDN):c.22+29A>G | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 1 and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_006073.4(TRDN):c.531del (p.Glu178fs) | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 1 and 1 other | Patogen/sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_006073.4(TRDN):c.502G>T (p.Glu168Ter) | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 1 | Patogen/sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_006073.4(TRDN):c.550+1_550+2insA | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 1 | Sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_006073.4(TRDN):c.391+1G>A | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 1 and 1 other | Sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_006073.4(TRDN):c.618del (p.Ala208fs) (opens in a new tab) | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 1 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NC_000006.12:g.123503896TCTGT[1] (opens in a new tab) | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 1 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_006073.4(TRDN):c.587dup (p.Glu197fs) (opens in a new tab) | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 1 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_006073.4(TRDN):c.573dup (p.Lys192fs) (opens in a new tab) | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 1 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_006073.4(TRDN):c.568dup (p.Ile190fs) (opens in a new tab) | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 1 and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_006073.4(TRDN):c.541G>T (p.Glu181Ter) (opens in a new tab) | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 1 and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_006073.4(TRDN):c.532_533del (p.Glu178fs) (opens in a new tab) | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 1 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_006073.4(TRDN):c.529A>T (p.Lys177Ter) (opens in a new tab) | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 1 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_006073.4(TRDN):c.521del (p.Val174fs) (opens in a new tab) | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 1 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_006073.4(TRDN):c.507dup (p.Gly170fs) (opens in a new tab) | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 1 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_006073.4(TRDN):c.508G>T (p.Gly170Ter) (opens in a new tab) | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 5 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_006073.4(TRDN):c.451C>T (p.Gln151Ter) (opens in a new tab) | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 1 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_006073.4(TRDN):c.438_442del (p.Asp146_Lys147insTer) (opens in a new tab) | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 1 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_006073.4(TRDN):c.439_440del (p.Lys147fs) (opens in a new tab) | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 1 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_006073.4(TRDN):c.424G>T (p.Glu142Ter) (opens in a new tab) | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 1 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_006073.4(TRDN):c.423del (p.Glu142fs) (opens in a new tab) | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_006073.4(TRDN):c.334del (p.Asp112fs) (opens in a new tab) | catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 1 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
See all 55 with every other TRDN variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Gener knyttet til de samme sygdomme
- CALM1calmodulin 1Deler 3 sygdomme
- CALM2calmodulin 2Deler 3 sygdomme
- CALM3calmodulin 3Deler 3 sygdomme
- CASQ2calsequestrin 2Deler 2 sygdomme
- RYR2ryanodine receptor 2Deler 2 sygdomme
- TECRLtrans-2,3-enoyl-CoA reductase likeDeler 2 sygdomme
- CACNA1Ccalcium voltage-gated channel subunit alpha1 CDeler 1 sygdom
- KCNE1potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 1Deler 1 sygdom
- KCNH2potassium voltage-gated channel subfamily H member 2Deler 1 sygdom
- KCNJ2potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 2Deler 1 sygdom
- KCNQ1potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1Deler 1 sygdom
- SCN5Asodium voltage-gated channel alpha subunit 5Deler 1 sygdom
Træk knyttet til TRDN
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, TRDN kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-18: hvilke tilstande genet er forbundet med, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende steder og de regioner, som korte læsninger har svært ved.
- Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.18-8b139e39.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). TRDN-genet: triadin. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/trdn
Dante Labs. TRDN-genet: triadin [Internet]. [citeret 18. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/trdn
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger