Gen
CASQ2
calsequestrin 2
- HGNC 1513↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000118729↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 845↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 1p13.1
- Koordinater
- Kromosom 1: 115.700.021–115.768.714 (GRCh38)
- Exoner
- 11 exoner fordelt over 68,7 kb
- Protein
- 399 aminosyrer
- Også kendt som
- PDIB2
- MANE Select-transkript
- ENST00000261448.6NM_001232.4
- Lokustype
- gene with protein product
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
ReferencegenomGRCh38hg38
Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.
Læs CASQ2 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurateret rapport relevant for dette gen
Katekolaminerget polymorf ventrikulær takykardi
- Familiær ventrikulær takykardi
Et tilfælde af ventrikulær takykardi, som skyldes en arvelig ændring i personens genom.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 4 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
- På ACMG's liste over sekundære fund
- Polymorf ventrikulær takykardi
En ventrikulær takykardi med uregelmæssig frekvens og rytme.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 4 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
- På ACMG's liste over sekundære fund
Sådan er CASQ2 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
- Varianter med en side
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 2,6 kb af genets 68,7 kb; 1.200 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest CASQ2
71
positioner i CASQ2, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved.
En helgenomsanalyse dækker alle 68,7 kb af CASQ2, inklusive introner, og ikke kun de 2,6 kb eksoner.
Varianter med en side (15)
Her vises de CASQ2-varianter med en side, med de flest anmeldelsesstjerner først. Hver side beskriver ClinVars offentlige registrering af varianten, aldrig et resultat.
| Variant | HGVS c. | Exon eller intron | Position (GRCh38) | ClinVar-klassifikation | Gennemgangsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| c.320-2A>G | Intron 2 | 115.740.830 | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter | |
| c.381C>T | Exon 3 | 115.740.767 | Sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter | |
| c.737+1G>A | Intron 6 | 115.726.991 | Sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter | |
| c.939+1G>T | Intron 9 | 115.705.191 | Sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter | |
| c.939+5G>C | Intron 9 | 115.705.187 | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter | |
| c.940-1G>T | Intron 9 | 115.702.996 | Sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter | |
| D340X | c.1017dup | Exon 11 | 115.701.423 | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| F182Lfs*28 | c.546del | Exon 5 | 115.732.960 | Patogen/sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| P308L | c.923C>T | Exon 9 | 115.705.208 | Sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| Q71Hfs*2 | c.213del | Exon 1 | 115.768.328 | Sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
Gener knyttet til de samme sygdomme
Træk knyttet til CASQ2
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, CASQ2 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). CASQ2-genet: calsequestrin 2. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/casq2
Dante Labs. CASQ2-genet: calsequestrin 2 [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/casq2
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger