Gen
UQCRFS1
ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1
- HGNC 12587↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000169021↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 7386↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 19q12
- Souřadnice
- Chromozom 19: 29 205 320–29 213 151 (GRCh38)
- Exony
- 2 exonů na 7,8 kb
- Protein
- 274 aminokyselin
- Další názvy
- ISP, RIS1, RIP1, UQCR5, RISP
- Transkript MANE Select
- ENST00000304863.6NM_006003.3
- Typ lokusu
- Kódující proteiny
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/uqcrfs1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si UQCRFS1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Primary Mitochondrial Disease
- Mitochondrial Respiratory Chain Complex Deficiency
Jeden z 61 genů spojených s touto vazbou
Isolated deficiencies of complex I, II, III, IV or V, caused by variants in nuclear or mitochondrial genes, which can affect the brain, muscles, heart, liver and other energy-demanding organs.
- 2 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
▶Akcionabilita
Knowing can end a diagnostic search and guide surveillance of affected organs and avoidance of drugs toxic to mitochondria.
Jak je UQCRFS1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 3,1 kb z 7,8 kb genu; 825 těchto bází kódují protein.
Sekvenování UQCRFS1
47Obtížné
Jak obtížně se UQCRFS1 sekvenuje krátkými čteními, ze 100
0 · Snadné100 · Obtížné
Velká část genu UQCRFS1 leží tam, kde krátká čtení mohou změnu přehlédnout nebo ji zařadit na špatné místo.
Co k tomu přispívá: podíl exonů genu UQCRFS1 v každém druhu obtížné oblasti
- MapovatelnostÚseky, kde nelze čtení o délce 100 nebo 250 bp jednoznačně umístit, takže volání v nich může chybět nebo být chybné. Gen zcela v tomto druhu oblasti by samostatně získal skóre 100.33 %
- HomologieSegmentální duplikace: kopie jinde v genomu, například paralogy a pseudogeny, s identitou 90 % nebo vyšší. Gen zcela v tomto druhu oblasti by samostatně získal skóre 60.33 %
- Sdíleno s chrYPseudoautozomální oblasti a oblast X-transponovaná, kde chrX a chrY nesou stejnou nebo téměř stejnou sekvenci, takže čtení z jednoho může být umístěno na druhém. Gen zcela v tomto druhu oblasti by samostatně získal skóre 60.0 %
- Pokrytí referenční sekvenceMezery v referenční sestavě v okolí, kde pro čtení není sekvence, na kterou by se mohla zarovnat. Gen zcela v tomto druhu oblasti by samostatně získal skóre 50.0 %
- RepeticeTandemové repetice a série jedné báze, na kterých čtení sklouzávají a které nemusí přečíst celé. Gen zcela v tomto druhu oblasti by samostatně získal skóre 30.1,3 %
- Obsah GCOkna s méně než 25 % nebo více než 65 % G a C, která příprava knihovny pokrývá řídce. Gen zcela v tomto druhu oblasti by samostatně získal skóre 20.8 %
Skóre Dante Labs z vlastního výzkumu, vycházející z map obtížně sekvenovatelných oblastí NIST Genome in a Bottle.Jak se skóre počítáKaždý sloupec udává podíl bází exonů genu UQCRFS1 v daném druhu obtížné oblasti. Každý druh sám o sobě může gen učinit obtížným a každý další přidává méně: 0, pokud žádná báze nespadá do žádné z oblastí, 100, pokud každá báze leží tam, kde čtení nelze jednoznačně umístit.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ACAD9acyl-CoA dehydrogenase family member 9Sdílí 1 onemocnění
- ATP5F1AATP synthase F1 subunit alphaSdílí 1 onemocnění
- ATP5F1DATP synthase F1 subunit deltaSdílí 1 onemocnění
- ATP5F1EATP synthase F1 subunit epsilonSdílí 1 onemocnění
- BCS1LBCS1 ubiquinol-cytochrome c reductase complex chaperoneSdílí 1 onemocnění
- COA6cytochrome c oxidase assembly factor 6Sdílí 1 onemocnění
- COA8cytochrome c oxidase assembly factor 8Sdílí 1 onemocnění
- COX10cytochrome c oxidase assembly factor heme A:farnesyltransferase COX10Sdílí 1 onemocnění
- COX15cytochrome c oxidase assembly factor COX15Sdílí 1 onemocnění
- COX16cytochrome c oxidase assembly factor COX16Sdílí 1 onemocnění
- COX20cytochrome c oxidase assembly factor COX20Sdílí 1 onemocnění
- COX6B1cytochrome c oxidase subunit 6B1Sdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s UQCRFS1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit UQCRFS1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud to pochází
- HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-19: se kterými stavy je gen spojen a jak silně.
- Seznam ACMG pro sekundární nálezy, SF v3.2.
- Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.19-9814e911.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen UQCRFS1: ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1. Staženo 20. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/uqcrfs1
Dante Labs. Gen UQCRFS1: ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 [Internet]. [citováno 20. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/uqcrfs1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů