Gen
MSH4
mutS homolog 4
- HGNC 7327↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000057468↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 4438↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 1p31.1
- Souřadnice
- Chromozom 1: 75 796 882–75 913 242 (GRCh38)
- Exony
- 20 exonů na 116,4 kb
- Protein
- 936 aminokyselin
- Transkript MANE Select
- ENST00000263187.4NM_002440.4
- Typ lokusu
- Protein-coding
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/msh4.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si MSH4 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Female Infertility
Diminished or absent ability of a female to achieve conception.
- 2 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Jak je MSH4 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 3,3 kb z 116,4 kb genu; 2 811 těchto bází kódují protein.
Sekvenování MSH4
3
pozic v MSH4, kde ClinVar zařazuje změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádná z nich nespadá do oblasti, kterou krátká čtení těžko zachytí.
Sekvenování celého genomu pokrývá všech 116,4 kb genu MSH4, včetně intronů, nikoli jen 3,3 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ANKRD31ankyrin repeat domain 31Sdílí 1 onemocnění
- ATMATM serine/threonine kinaseSdílí 1 onemocnění
- BMP15bone morphogenetic protein 15Sdílí 1 onemocnění
- BNC1basonuclin zinc finger protein 1Sdílí 1 onemocnění
- CLPPcaseinolytic mitochondrial matrix peptidase proteolytic subunitSdílí 1 onemocnění
- CYP19A1cytochrome P450 family 19 subfamily A member 1Sdílí 1 onemocnění
- FANCMFA complementation group MSdílí 1 onemocnění
- FIGLAfolliculogenesis specific bHLH transcription factorSdílí 1 onemocnění
- FMR1fragile X messenger ribonucleoprotein 1Sdílí 1 onemocnění
- FOXL2forkhead box L2Sdílí 1 onemocnění
- FSHRfollicle stimulating hormone receptorSdílí 1 onemocnění
- GALTgalactose-1-phosphate uridylyltransferaseSdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s MSH4
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit MSH4. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-17: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.17-8666dff2.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen MSH4: mutS homolog 4. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/msh4
Dante Labs. Gen MSH4: mutS homolog 4 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/msh4
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů