Gen
PTCHD1
patched domain containing 1
- HGNC 26392↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000165186↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 139411↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- Xp22.11
- Koordinatlar
- Kromozom X: 23.334.849–23.404.374 (GRCh38)
- Eksonlar
- 69,5 kb boyunca 3 ekson
- Protein
- 888 amino asit
- Diğer adları
- SLC65C1, FLJ30296
- MANE Select transkripti
- ENST00000379361.5NM_173495.3
- Lokus türü
- gene with protein product
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Referans genomGRCh38hg38
Gen ve varyant sayfalarındaki konumlar, bu tarayıcıda yaptığınız bu seçimi izler.
PTCHD1 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili raporlar
Otizm Spektrum Bozukluğu
- Otizm, yatkınlık (tek gen formları)
Otizme tek gen katkıları; NLGN3, NLGN4X, PTCHD1, SHANK2, TBR1 ve CHD8 genlerindeki varyantları içerir.
- 3 GenCC bildiren kurum, bunu kesin veya güçlü olarak derecelendiriyor
Epilepsi (Tam Panel)
- X'e Bağlı Kompleks Nörogelişimsel Bozukluk
X'e bağlı kalıtılan, entelektüel yetersizlik, otizm ve epilepsi ile karakterize kompleks bir nörogelişimsel bozukluktur.
- ClinGen bu bağlantıyı kesin olarak derecelendiriyor
- 1 GenCC bildiren kurum, bunu kesin veya güçlü olarak derecelendiriyor
Daha geniş gruplar
Zihinsel Yetersizlik
Buna bağlı 233 gen arasından biri
- 1 GenCC bildiren kurum, bunu kesin veya güçlü olarak derecelendiriyor
PTCHD1 geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 69,5 kb uzunluğunun 12,9 kb'sini oluşturur; bu bazların 2.667 tanesi proteini kodlar.
Bir genom testi PTCHD1 genini nasıl okur
8
PTCHD1 içinde, ClinVar'ın bir değişikliği patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı konumlar
Bunların hiçbiri, kısa okumaların zorlandığı bir bölgeye düşmüyor.
Tam genom, PTCHD1 genindeki 69,5 kb'lik bölgenin tamamını kapsar; yalnızca 12,9 kb'lik ekzonları değil, intronlar da dahil olmak üzere.
Aynı durumlarla ilişkili genler
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 92 durumu paylaşıyor
- CHD8chromodomain helicase DNA binding protein 82 durumu paylaşıyor
- CLCN4Cl-/H+ antiporter 42 durumu paylaşıyor
- CNKSR2connector enhancer of kinase suppressor of Ras 22 durumu paylaşıyor
- FRMPD4FERM and PDZ domain containing 42 durumu paylaşıyor
- FTSJ1FtsJ RNA 2'-O-methyltransferase 12 durumu paylaşıyor
- GRIA3glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 32 durumu paylaşıyor
- HNRNPH2heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H22 durumu paylaşıyor
- IL1RAPL1interleukin 1 receptor accessory protein like 12 durumu paylaşıyor
- IQSEC2IQ motif and Sec7 domain ArfGEF 22 durumu paylaşıyor
- KDM5Clysine demethylase 5C2 durumu paylaşıyor
- NEXMIFneurite extension and migration factor2 durumu paylaşıyor
PTCHD1 ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, PTCHD1 geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'dan MANE Select v1.5: transkript, eksonları ve kodlayıcı dizisi.
- GenCC ve ClinGen, 2026-10-16 sürümü: genin hangi durumlarla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı bölgeler.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Veri sürümü 2026.10.16-c6eea6bf.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). PTCHD1 geni: patched domain containing 1. Erişim tarihi: 16 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/ptchd1
Dante Labs. PTCHD1 geni: patched domain containing 1 [Internet]. [alıntı tarihi 16 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/ptchd1
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde