Gen
SOX17
SRY-box transcription factor 17
- HGNC 18122↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000164736↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 64321↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 8q11.23
- Koordinater
- Kromosom 8: 54 457 935–54 460 892 (GRCh38)
- Exoner
- 2 exoner på 3 kb
- Protein
- 414 aminosyror
- MANE Select-transkript
- ENST00000297316.5NM_022454.4
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs SOX17, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Medfödda missbildningar i njurar och urinvägar
- Vesikoureteral reflux
Bakåtflöde av urin från urinblåsan mot njurarna, som kan förekomma i familjer och ökar risken för njurinfektion och ärrbildning.
- 2 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Om du vet detta kan det leda till tidigare utredning av urinvägsinfektioner hos dig och dina barn.
Så är SOX17 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 2,3 kb av genens 3 kb, och 1 245 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest SOX17
4
positioner i SOX17 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 3 kb av SOX17, med introner inräknade, inte bara de 2,3 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
Egenskaper kopplade till SOX17
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SOX17 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the cardiovascular system
- Cardiac failure
- Heart stops beating
- Increased blood pressure in blood vessels of lungs
- Increased pulmonary vascular resistance
- Left ventricular systolic dysfunction
- Patent ductus arteriosus
- Quivering upper heart chambers resulting in irregular heartbeat
- Right ventricular dilatation
Visa ytterligare 15 egenskaper
- Right ventricular hypertrophy
- Pulmonary arterial hypertension with lack of acute response to NO challenge
- Right axis deviation
- Bronchial artery dilatation
- Narrowing of pulmonic valve
- Right atrial enlargement
- Stroke
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Complete right bundle branch block
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
- Incomplete right bundle branch block
- Interrupted inferior vena cava with azygous continuation
- Patent foramen ovale
- Pulmonary arterial hypertension with positive acute response to NO challenge
- Reduced systolic function
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SOX17-genen: SRY-box transcription factor 17. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/sox17
Dante Labs. SOX17-genen: SRY-box transcription factor 17 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/sox17
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor