Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA

Gen

CSNK2A1

casein kinase 2 alpha 1

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
20p13
Koordinater
Kromosom 20: 472 498–543 790 (GRCh38)
Eksoner
14 eksoner over 71,3 kb
Protein
391 aminosyrer
Også kjent som
Cka1, Cka2
MANE Select-transkripsjon
ENST00000217244.9NM_177559.3
Lokustype
gene with protein product
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

ReferansegenomGRCh38

Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.

Kuratert rapport som er relevant for dette genet

    Slik er CSNK2A1 bygget opp

    • Kodende sekvens
    • Utranslatert region
    • Intron
    • Transkripsjonsretning
    • Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
    • Områder som korte avlesninger sliter med
    Kromosom 20, med en parentes der CSNK2A1 står. CSNK2A1 og 21 gener i nærheten på kromosom 20, fra 8 144 til 1 008 143.Kromosom 2020p13p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.330,2 Mb0,4 Mb0,6 Mb0,8 Mb1 MbDEFB125: 87 250–97 094, fremover-strengDEFB125DEFB126: 142 590–145 751, fremover-strengDEFB126DEFB127: 157 454–159 163, fremover-strengDEFB127DEFB128: 187 853–189 711, bakover-strengDEFB128DEFB129: 227 258–229 886, fremover-strengDEFB129DEFB132: 257 717–261 096, fremover-strengDEFB132C20orf96: 270 863–290 778, bakover-strengC20orf96ZCCHC3: 297 570–300 321, fremover-strengZCCHC3SOX12: 325 552–330 224, fremover-strengSOX12NRSN2: 346 695–359 706, fremover-strengNRSN2TRIB3: 362 835–398 964, fremover-strengTRIB3RBCK1: 407 393–432 139, fremover-strengRBCK1TBC1D20: 423 596–462 566, bakover-strengTBC1D20CSNK2A1: 472 498–543 790, bakover-strengCSNK2A1TCF15: 603 801–610 316, bakover-strengTCF15SRXN1: 646 614–653 404, bakover-strengSRXN1: 646 626–675 800, bakover-strengSCRT2: 661 596–675 802, bakover-strengSCRT2SLC52A3: 758 695–776 015, bakover-strengSLC52A3FAM110A: 833 707–857 463, fremover-strengFAM110AANGPT4: 869 900–916 335, bakover-strengANGPT4RSPO4: 958 452–1 002 510, bakover-strengRSPO4Diagram av CSNK2A1: 14 eksoner på bakover-strengen til kromosom 20Ekson 12: 8 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 10: 3 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 9: 12 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 8: 6 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 7: 2 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 6: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 5: 3 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 4: 11 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 3: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 14: 472 498–484 076, 11 579 baserEkson 13: 486 376–486 462, 87 baserEkson 12: 487 427–487 575, 149 baserEkson 11: 488 678–488 778, 101 baserEkson 10: 489 780–489 881, 102 baserEkson 9: 492 254–492 364, 111 baserEkson 8: 495 719–495 802, 84 baserEkson 7: 497 721–497 780, 60 baserEkson 6: 499 255–499 305, 51 baserEkson 5: 499 833–499 934, 102 baserEkson 4: 505 118–505 229, 112 baserEkson 3: 508 451–508 660, 210 baserEkson 2: 527 933–528 049, 117 baserEkson 1: 543 672–543 790, 119 baser141210864215′3′

    Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

    Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

    Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

    Eksonene utgjør 13 kb av genets 71,3 kb, og 1 176 av disse basene koder for proteinet.

    Slik leser en genetisk test CSNK2A1

    49

    posisjoner i CSNK2A1 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen

    5 av dem (10 %) faller i områder som korte avlesninger sliter med.

    • Low mappability (5 posisjoner)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.

    En helgenomsekvensering dekker alle 71,3 kb av CSNK2A1, inkludert introner, og ikke bare de 13 kb med eksoner.

    Hvor dette kommer fra

    • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
    • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
    • GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-16: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
    • ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
    • ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
    • The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
    • Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.

    Siter denne siden

    APA

    Dante Labs. (u.d.). CSNK2A1-genet: casein kinase 2 alpha 1. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/csnk2a1

    Vancouver

    Dante Labs. CSNK2A1-genet: casein kinase 2 alpha 1 [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/csnk2a1

    Én test. En livstid med svar.

    Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

    Få mitt Genome Test