Gen
CASQ2
calsequestrin 2
- HGNC 1513↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000118729↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 845↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 1p13.1
- Koordinater
- Kromosom 1: 115 700 021–115 768 714 (GRCh38)
- Eksoner
- 11 eksoner over 68,7 kb
- Protein
- 399 aminosyrer
- Også kjent som
- PDIB2
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000261448.6NM_001232.4
- Lokustype
- gene with protein product
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
ReferansegenomGRCh38hg38
Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.
Les CASQ2 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Katekolaminerg polymorf ventrikkeltakykardi
- Familiær ventrikkeltakykardi
En forekomst av ventrikkeltakykardi som skyldes en arvelig endring i individets genom.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
- På ACMGs liste over sekundære funn
- Polymorf ventrikkeltakykardi
En ventrikkeltakykardi med uregelmessig frekvens og rytme.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
- På ACMGs liste over sekundære funn
Slik er CASQ2 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
- Varianter med egen side
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 2,6 kb av genets 68,7 kb, og 1 200 av disse basene koder for proteinet.
Slik leser en genetisk test CASQ2
71
posisjoner i CASQ2 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem faller i et område som korte avlesninger sliter med.
En helgenomsekvensering dekker alle 68,7 kb av CASQ2, inkludert introner, og ikke bare de 2,6 kb med eksoner.
Varianter med egen side (15)
De CASQ2-variantene med egen side her, med flest stjerner for vurdering først. Hver side beskriver ClinVars offentlige opplysninger om varianten, aldri et resultat.
| Variant | HGVS c. | Ekson eller intron | Posisjon (GRCh38) | ClinVar-klassifisering | Vurderingsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| c.320-2A>G | Intron 2 | 115 740 830 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter | |
| c.381C>T | Ekson 3 | 115 740 767 | Sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter | |
| c.737+1G>A | Intron 6 | 115 726 991 | Sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter | |
| c.939+1G>T | Intron 9 | 115 705 191 | Sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter | |
| c.939+5G>C | Intron 9 | 115 705 187 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter | |
| c.940-1G>T | Intron 9 | 115 702 996 | Sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter | |
| D340X | c.1017dup | Ekson 11 | 115 701 423 | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| F182Lfs*28 | c.546del | Ekson 5 | 115 732 960 | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| P308L | c.923C>T | Ekson 9 | 115 705 208 | Sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| Q71Hfs*2 | c.213del | Ekson 1 | 115 768 328 | Sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
Gener knyttet til de samme tilstandene
Egenskaper knyttet til CASQ2
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene CASQ2 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-16: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). CASQ2-genet: calsequestrin 2. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/casq2
Dante Labs. CASQ2-genet: calsequestrin 2 [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/casq2
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker