Gén
CASQ2
calsequestrin 2
- HGNC 1513↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000118729↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 845↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 1p13.1
- Koordináták
- 1. kromoszóma: 115 700 021–115 768 714 (GRCh38)
- Exonok
- 11 exon, összesen 68,7 kb
- Fehérje
- 399 aminosav
- Más néven ismert
- PDIB2
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000261448.6NM_001232.4
- Lokusz típusa
- gene with protein product
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Referencia genomGRCh38hg38
A gén- és variánsoldalakon a pozíciók ennek a választásnak megfelelően jelennek meg, ebben a böngészőben.
Olvassa el a CASQ2-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Catecholaminergic Polymorphic Ventricular Tachycardia
- Ventricular Tachycardia, Familial
An instance of ventricular tachycardia that is caused by an inherited modification of the individual's genome.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: definitív
- 4 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
- Szerepel az ACMG másodlagos leletek listáján
- Polymorphic Ventricular Tachycardia
A ventricular tachycardia that is irregular in rate and rhythm.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: definitív
- 4 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
- Szerepel az ACMG másodlagos leletek listáján
A CASQ2 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
- Oldallal rendelkező variánsok
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 68,7 kb-jából 2,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1200 bázis kódolja a fehérjét.
Hogyan olvassa a genomteszt a(z) CASQ2 gént
71
pozíció a(z) CASQ2 génben, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül egyik sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen értelmeznek.
A teljes genom a CASQ2 gén mind a 68,7 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 2,6 kb exonját.
Oldallal rendelkező variánsok (15)
Az itt található, oldallal rendelkező CASQ2 variánsok, a legtöbb csillaggal rendelkezők először. Minden oldal a variáns ClinVar nyilvános adatbázisbeli bejegyzését írja le, sosem egy eredményt.
| Variáns | HGVS c. | Exon vagy intron | Pozíció (GRCh38) | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|---|---|
| c.320-2A>G | 2. intron | 115 740 830 | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás | |
| c.381C>T | 3. exon | 115 740 767 | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás | |
| c.737+1G>A | 6. intron | 115 726 991 | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás | |
| c.939+1G>T | 9. intron | 115 705 191 | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás | |
| c.939+5G>C | 9. intron | 115 705 187 | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás | |
| c.940-1G>T | 9. intron | 115 702 996 | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás | |
| D340X | c.1017dup | 11. exon | 115 701 423 | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| F182Lfs*28 | c.546del | 5. exon | 115 732 960 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| P308L | c.923C>T | 9. exon | 115 705 208 | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| Q71Hfs*2 | c.213del | 1. exon | 115 768 328 | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
A(z) CASQ2 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) CASQ2 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-16 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). CASQ2 gén: calsequestrin 2. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/casq2
Dante Labs. CASQ2 gén: calsequestrin 2 [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/casq2
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt