Genas
APRT
adenine phosphoribosyltransferase
- HGNC 626↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000198931↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 353↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 16q24.3
- Koordinatės
- Chromosoma 16: 88 809 339–88 811 928 (GRCh38)
- Eksonai
- 5 eksonų per 2,6 kb
- Baltymas
- 180 aminorūgščių
- MANE Select transkriptas
- ENST00000378364.8NM_000485.3
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/aprt.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite APRT ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
Purinų ir pirimidinų apykaitos sutrikimai
- Adenino fosforiboziltransferazės trūkumasAutosominis recesyvinis
Sukelia APRT genų variantai, dėl kurių susidaro 2,8-dihidroksiadenino inkstų akmenys ir kristalų sukeltas inkstų pažeidimas, kuris dažnai nepastebimas arba klaidingai diagnozuojamas.
- 3 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
▶Veiksmingumas
Žinant galima gydyti alopurinoliu arba febuksostatu ir gerti daug skysčių, o tai gali apsaugoti nuo inkstų nepakankamumo.
Kaip išdėstytas APRT
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 0,9 kb iš 2,6 kb geno; 543 šių bazių koduoja baltymą.
Sekoskaita: APRT
5Maža
Kiek sunku sekti APRT trumpaisiais skaitiniais, iš 100Kiekvienas stulpelis rodo APRT egzonų bazių dalį tokio tipo sunkiuose regionuose. Balas juos sveria pagal tai, kiek kiekvienas iš jų apsunkina trumpųjų skaitinių iškvietimą: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokį regioną, 100, kai kiekviena bazė patenka į visus jų.
- Atvaizdavimas į genomąRuožai, kuriuose 100 arba 250 bp skaitinių negali būti vienareikšmiškai įtvirtinti, todėl ten esantis rezultatas gali būti nerastas arba klaidingas. Svoris: 35 %.0 %
- HomologijaSegmentinės dublikacijos: kopijos kituose genomo vietose, pavyzdžiui paralogai ir pseudogenai, kai tapatumas 90 % ar didesnis. Svoris: 30 %.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido serijos, kuriose skaitiniai slysta ir gali neapimti. Svoris: 15 %.0 %
- GC kiekisLangai, kurių GC kiekis yra mažesnis nei 25 % arba didesnis nei 65 %, ir kuriuos bibliotekos paruošimas apima silpnai. Svoris: 10 %.52 %
- Nuorodinio genomo aprėptisSpragos nuorodinėje sekoje šalia, kur nėra sekos, prie kurios trumpieji skaitiniai galėtų prisijungti. Svoris: 10 %.0 %
38
APRT pozicijos, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba greičiausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpieji skaitiniai sunkiai aptinka.
Visas genomo sekoskaita apima visus 2,6 kb geno APRT, įskaitant intronus, o ne tik 0,9 kb eksonų.
Savybės, susijusios su APRT
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti APRT, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-17: su kokiomis ligomis genas siejamas ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir regionai, kuriuos trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.17-8666dff2.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). APRT genas: adenine phosphoribosyltransferase. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/aprt
Dante Labs. APRT genas: adenine phosphoribosyltransferase [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/aprt
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites