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Gène

SUPT16H

SPT16 homolog, facilitates chromatin remodeling subunit

Résumé

Localisation cytogénétique
14q11.2
Coordonnées
Chromosome 14 : 21 351 476–21 384 019 (GRCh38)
Exons
26 exons sur 32,5 kb
Protéine
1 047 acides aminés
Aussi appelé
FACT, FACTP140, SPT16/CDC68, FLJ14010, FLJ10857, CDC68
Transcrit MANE Select
ENST00000216297.7NM_007192.4
Type de locus
Protein-coding
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SUPT16H. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SUPT16H

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 14, avec un crochet à l'emplacement de SUPT16H. SUPT16H et 24 gènes à proximité sur le chromosome 14, de 20 867 748 à 21 867 747.Chromosome 1414q11.2p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.11q32.12q32.13q32.2q32.31q32.32q32.3321 Mb21,2 Mb21,4 Mb21,6 Mb21,8 MbRNASE3 : 20 882 394–20 892 348, brin directRNASE3RNASE2 : 20 955 345–20 956 436, brin directRNASE2METTL17 : 20 989 775–20 997 035, brin directSLC39A2 : 20 999 255–21 001 871, brin directNDRG2 : 21 016 584–21 071 094, brin inverseTPPP2 : 21 024 086–21 036 276, brin directTPPP2RNASE13 : 21 032 818–21 034 807, brin inverseRNASE7 : 21 042 316–21 044 234, brin directRNASE8 : 21 057 822–21 058 455, brin directRNASE8ARHGEF40 : 21 069 626–21 090 269, brin directARHGEF40ZNF219 : 21 089 468–21 104 722, brin inverseZNF219TMEM253 : 21 098 811–21 103 724, brin directTMEM253OR5AU1 : 21 148 370–21 159 060, brin inverseOR5AU1HNRNPC : 21 207 375–21 269 792, brin inverseHNRNPCRPGRIP1 : 21 280 083–21 351 301, brin directRPGRIP1SUPT16H : 21 351 476–21 384 019, brin inverseSUPT16HCHD8 : 21 385 194–21 456 126, brin inverseCHD8RAB2B : 21 458 704–21 476 973, brin inverseRAB2BTOX4 : 21 476 597–21 504 234, brin directTOX4METTL3 : 21 498 127–21 511 430, brin inverseMETTL3SALL2 : 21 521 080–21 537 230, brin inverseSALL2OR10G3 : 21 568 520–21 580 076, brin inverseOR10G3OR10G2 : 21 633 836–21 634 940, brin inverseOR10G2OR4E2 : 21 653 835–21 667 642, brin directOR4E2OR4E1 : 21 667 886–21 673 818, brin inverseOR4E1Schéma de SUPT16H : 26 exons sur le brin inverse du chromosome 14Exon 22 : 1 site connu associé à une maladieExon 19 : 1 site connu associé à une maladieExon 18 : 1 site connu associé à une maladieExon 13 : 1 site connu associé à une maladieExon 10 : 1 site connu associé à une maladieExon 26 : 21 351 476–21 352 818, 1 343 basesExon 25 : 21 353 488–21 353 565, 78 basesExon 24 : 21 353 703–21 353 832, 130 basesExon 23 : 21 354 411–21 354 540, 130 basesExon 22 : 21 357 197–21 357 366, 170 basesExon 21 : 21 357 927–21 358 002, 76 basesExon 20 : 21 358 315–21 358 427, 113 basesExon 19 : 21 359 484–21 359 609, 126 basesExon 18 : 21 360 415–21 360 533, 119 basesExon 17 : 21 360 846–21 360 972, 127 basesExon 16 : 21 361 078–21 361 213, 136 basesExon 15 : 21 362 197–21 362 324, 128 basesExon 14 : 21 362 794–21 362 947, 154 basesExon 13 : 21 363 034–21 363 149, 116 basesExon 12 : 21 363 233–21 363 328, 96 basesExon 11 : 21 363 438–21 363 503, 66 basesExon 10 : 21 364 827–21 364 939, 113 basesExon 9 : 21 365 070–21 365 143, 74 basesExon 8 : 21 366 439–21 366 529, 91 basesExon 7 : 21 368 269–21 368 441, 173 basesExon 6 : 21 369 204–21 369 355, 152 basesExon 5 : 21 369 750–21 369 896, 147 basesExon 4 : 21 370 336–21 370 488, 153 basesExon 3 : 21 371 874–21 372 044, 171 basesExon 2 : 21 373 338–21 373 430, 93 basesExon 1 : 21 383 862–21 384 019, 158 bases2625201510515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4,4 kb sur les 32,5 kb du gène ; 3 144 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de SUPT16H

5

positions de SUPT16H où ClinVar classe une variante comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 32,5 kb de SUPT16H, introns compris, et pas seulement les 4,4 kb d'exons.

Traits associés à SUPT16H

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que SUPT16H peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.17-8666dff2.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SUPT16H : SPT16 homolog, facilitates chromatin remodeling subunit. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/supt16h

Vancouver

Dante Labs. Gène SUPT16H : SPT16 homolog, facilitates chromatin remodeling subunit [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/supt16h

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