Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

SUPT16H

SPT16 homolog, facilitates chromatin remodeling subunit

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
14q11.2
Koordinaadid
Kromosoom 14: 21 351 476–21 384 019 (GRCh38)
Eksonid
26 eksonit, ulatus 32,5 kb
Valk
1047 aminohapet
Tuntud ka kui
FACT, FACTP140, SPT16/CDC68, FLJ14010, FLJ10857, CDC68
MANE Select transkript
ENST00000216297.7NM_007192.4
Lookuse tüüp
Protein-coding
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni SUPT16H veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas SUPT16H on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 14, millel on sulg kohal, kus asub SUPT16H. SUPT16H ja sellele lähedal asuvad 24 geeni kromosoomil 14, vahemikus 20 867 748 kuni 21 867 747.Kromosoom 1414q11.2p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.11q32.12q32.13q32.2q32.31q32.32q32.3321 Mb21,2 Mb21,4 Mb21,6 Mb21,8 MbRNASE3: 20 882 394–20 892 348, otsene ahelRNASE3RNASE2: 20 955 345–20 956 436, otsene ahelRNASE2METTL17: 20 989 775–20 997 035, otsene ahelSLC39A2: 20 999 255–21 001 871, otsene ahelNDRG2: 21 016 584–21 071 094, pöördne ahelTPPP2: 21 024 086–21 036 276, otsene ahelTPPP2RNASE13: 21 032 818–21 034 807, pöördne ahelRNASE7: 21 042 316–21 044 234, otsene ahelRNASE8: 21 057 822–21 058 455, otsene ahelRNASE8ARHGEF40: 21 069 626–21 090 269, otsene ahelARHGEF40ZNF219: 21 089 468–21 104 722, pöördne ahelZNF219TMEM253: 21 098 811–21 103 724, otsene ahelTMEM253OR5AU1: 21 148 370–21 159 060, pöördne ahelOR5AU1HNRNPC: 21 207 375–21 269 792, pöördne ahelHNRNPCRPGRIP1: 21 280 083–21 351 301, otsene ahelRPGRIP1SUPT16H: 21 351 476–21 384 019, pöördne ahelSUPT16HCHD8: 21 385 194–21 456 126, pöördne ahelCHD8RAB2B: 21 458 704–21 476 973, pöördne ahelRAB2BTOX4: 21 476 597–21 504 234, otsene ahelTOX4METTL3: 21 498 127–21 511 430, pöördne ahelMETTL3SALL2: 21 521 080–21 537 230, pöördne ahelSALL2OR10G3: 21 568 520–21 580 076, pöördne ahelOR10G3OR10G2: 21 633 836–21 634 940, pöördne ahelOR10G2OR4E2: 21 653 835–21 667 642, otsene ahelOR4E2OR4E1: 21 667 886–21 673 818, pöördne ahelOR4E1SUPT16H skeem: 26 eksonit kromosoomi 14 pöördne ahelalEkson 22: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 19: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 18: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 13: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 10: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 26: 21 351 476–21 352 818, 1343 alustEkson 25: 21 353 488–21 353 565, 78 alustEkson 24: 21 353 703–21 353 832, 130 alustEkson 23: 21 354 411–21 354 540, 130 alustEkson 22: 21 357 197–21 357 366, 170 alustEkson 21: 21 357 927–21 358 002, 76 alustEkson 20: 21 358 315–21 358 427, 113 alustEkson 19: 21 359 484–21 359 609, 126 alustEkson 18: 21 360 415–21 360 533, 119 alustEkson 17: 21 360 846–21 360 972, 127 alustEkson 16: 21 361 078–21 361 213, 136 alustEkson 15: 21 362 197–21 362 324, 128 alustEkson 14: 21 362 794–21 362 947, 154 alustEkson 13: 21 363 034–21 363 149, 116 alustEkson 12: 21 363 233–21 363 328, 96 alustEkson 11: 21 363 438–21 363 503, 66 alustEkson 10: 21 364 827–21 364 939, 113 alustEkson 9: 21 365 070–21 365 143, 74 alustEkson 8: 21 366 439–21 366 529, 91 alustEkson 7: 21 368 269–21 368 441, 173 alustEkson 6: 21 369 204–21 369 355, 152 alustEkson 5: 21 369 750–21 369 896, 147 alustEkson 4: 21 370 336–21 370 488, 153 alustEkson 3: 21 371 874–21 372 044, 171 alustEkson 2: 21 373 338–21 373 430, 93 alustEkson 1: 21 383 862–21 384 019, 158 alust2625201510515′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 4,4 kb kogupikkusega 32,5 kb; neist 3144 alust kodeerivad valku.

Sekveneerimine: SUPT16H

5

SUPT16H positsioonid, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu piirkonnas, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.

Terve genoom katab kogu SUPT16H geeni 32,5 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 4,4 kb eksoneid.

Geeniga SUPT16H seotud tunnused

Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida SUPT16H võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). SUPT16H geen: SPT16 homolog, facilitates chromatin remodeling subunit. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/supt16h

Vancouver

Dante Labs. SUPT16H geen: SPT16 homolog, facilitates chromatin remodeling subunit [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/supt16h

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test