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Gène

SLCO1B3

solute carrier organic anion transporter family member 1B3

Résumé

Localisation cytogénétique
12p12.2
Coordonnées
Chromosome 12 : 20 810 705–20 916 911 (GRCh38)
Exons
16 exons sur 106,2 kb
Protéine
702 acides aminés
Aussi appelé
OATP8, OATP1B3
Symboles précédents
SLC21A8
Transcrit MANE Select
ENST00000381545.8NM_019844.4
Type de locus
Protein-coding
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SLCO1B3. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SLCO1B3

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 12, avec un crochet à l'emplacement de SLCO1B3. SLCO1B3 et 7 gènes à proximité sur le chromosome 12, de 20 363 808 à 21 363 807.Chromosome 1212p12.2p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3320,4 Mb20,6 Mb20,8 Mb21 Mb21,2 MbPDE3A : 20 368 322–20 688 583, brin directPDE3ASLCO1C1 : 20 695 332–20 753 386, brin directSLCO1C1SLCO1B3 : 20 810 705–20 916 911, brin directSLCO1B3SLCO1B3-SLCO1B7 : 20 815 674–21 090 245, brin directSLCO1B3-SLCO1B7 : 21 047 179–21 176 895, brin directSLCO1B1 : 21 127 862–21 298 065, brin directSLCO1B1SLCO1A2 : 21 264 600–21 419 676, brin inverseSLCO1A2IAPP : 21 354 959–21 379 980, brin directIAPPSchéma de SLCO1B3 : 16 exons sur le brin direct du chromosome 12Exon 13 : 1 site connu associé à une maladieExon 1 : 20 810 705–20 810 764, 60 basesExon 2 : 20 813 524–20 813 638, 115 basesExon 3 : 20 815 674–20 815 822, 149 basesExon 4 : 20 855 028–20 855 169, 142 basesExon 5 : 20 858 439–20 858 571, 133 basesExon 6 : 20 861 017–20 861 138, 122 basesExon 7 : 20 862 412–20 862 558, 147 basesExon 8 : 20 862 756–20 862 854, 99 basesExon 9 : 20 875 235–20 875 477, 243 basesExon 10 : 20 877 772–20 877 936, 165 basesExon 11 : 20 879 436–20 879 631, 196 basesExon 12 : 20 880 855–20 881 020, 166 basesExon 13 : 20 883 418–20 883 602, 185 basesExon 14 : 20 898 436–20 898 500, 65 basesExon 15 : 20 901 350–20 901 467, 118 basesExon 16 : 20 916 004–20 916 911, 908 bases12468101214165′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3 kb sur les 106,2 kb du gène ; 2 109 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de SLCO1B3

6

positions de SLCO1B3 où ClinVar classe une variante comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 106,2 kb de SLCO1B3, introns compris, et pas seulement les 3 kb d'exons.

Traits associés à SLCO1B3

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que SLCO1B3 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.17-8666dff2.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SLCO1B3 : solute carrier organic anion transporter family member 1B3. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/slco1b3

Vancouver

Dante Labs. Gène SLCO1B3 : solute carrier organic anion transporter family member 1B3 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/slco1b3

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