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Gène

SLCO1C1

solute carrier organic anion transporter family member 1C1

Résumé

Localisation cytogénétique
12p12.2
Coordonnées
Chromosome 12 : 20 695 332–20 753 386 (GRCh38)
Exons
15 exons sur 58,1 kb
Protéine
712 acides aminés
Aussi appelé
OATP-F, OATP1C1, OATP1
Symboles précédents
SLC21A14
Transcrit MANE Select
ENST00000266509.7NM_017435.5
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SLCO1C1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SLCO1C1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 12, avec un crochet à l'emplacement de SLCO1C1. SLCO1C1 et 5 gènes à proximité sur le chromosome 12, de 20 224 359 à 21 224 358.Chromosome 1212p12.2p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3320,4 Mb20,6 Mb20,8 Mb21 Mb21,2 MbPDE3A : 20 368 322–20 688 583, brin directPDE3ASLCO1C1 : 20 695 332–20 753 386, brin directSLCO1C1SLCO1B3 : 20 806 645–20 918 230, brin directSLCO1B3SLCO1B3-SLCO1B7 : 20 815 674–21 090 245, brin directSLCO1B3-SLCO1B7 : 21 047 179–21 176 895, brin directSLCO1B1 : 21 127 862–21 298 065, brin directSLCO1B1Schéma de SLCO1C1 : 15 exons sur le brin direct du chromosome 12Exon 1 : 20 695 332–20 695 807, 476 basesExon 2 : 20 699 552–20 699 705, 154 basesExon 3 : 20 701 318–20 701 459, 142 basesExon 4 : 20 705 949–20 706 081, 133 basesExon 5 : 20 711 386–20 711 510, 125 basesExon 6 : 20 715 139–20 715 285, 147 basesExon 7 : 20 717 132–20 717 230, 99 basesExon 8 : 20 721 804–20 722 049, 246 basesExon 9 : 20 723 090–20 723 254, 165 basesExon 10 : 20 732 909–20 733 104, 196 basesExon 11 : 20 737 107–20 737 272, 166 basesExon 12 : 20 740 184–20 740 368, 185 basesExon 13 : 20 743 305–20 743 369, 65 basesExon 14 : 20 750 675–20 750 792, 118 basesExon 15 : 20 752 306–20 753 386, 1 081 bases1234567891011121314155′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,5 kb sur les 58,1 kb du gène ; 2 139 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de SLCO1C1

0Faible

Difficulté de séquençage de SLCO1C1 avec des lectures courtes, sur 100

  • Cartographiabilité0 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions0 %
  • Teneur en GC1,2 %
  • Couverture de référence0 %

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SLCO1C1 : solute carrier organic anion transporter family member 1C1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/slco1c1

Vancouver

Dante Labs. Gène SLCO1C1 : solute carrier organic anion transporter family member 1C1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/slco1c1

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