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Gène

NUP54

nucleoporin 54

Résumé

Localisation cytogénétique
4q21.1
Coordonnées
Chromosome 4 : 76 114 664–76 148 397 (GRCh38)
Exons
12 exons sur 33,7 kb
Protéine
507 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000264883.8NM_017426.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore NUP54. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de NUP54

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 4, avec un crochet à l'emplacement de NUP54. NUP54 et 15 gènes à proximité sur le chromosome 4, de 75 631 531 à 76 631 530.Chromosome 44q21.1p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.275,8 Mb76 Mb76,2 Mb76,4 Mb76,6 MbG3BP2 : 75 641 849–75 726 301, brin inverseG3BP2USO1 : 75 724 522–75 814 290, brin directUSO1PPEF2 : 75 859 864–75 902 571, brin inversePPEF2NAAA : 75 910 655–75 941 118, brin inverseNAAASDAD1 : 75 940 950–75 990 962, brin inverseSDAD1CXCL9 : 76 001 275–76 007 515, brin inverseCXCL9ART3 : 76 011 176–76 114 094, brin directART3CXCL10 : 76 021 118–76 023 518, brin inverseCXCL10CXCL11 : 76 033 682–76 050 206, brin inverseCXCL11NUP54 : 76 114 664–76 148 397, brin inverseNUP54SCARB2 : 76 158 723–76 234 536, brin inverseSCARB2FAM47E : 76 214 040–76 284 296, brin directFAM47EFAM47E-STBD1 : 76 251 721–76 311 129, brin directFAM47E-STBD1STBD1 : 76 306 275–76 314 086, brin directSTBD1CCDC158 : 76 312 997–76 421 868, brin inverseCCDC158SHROOM3 : 76 435 158–76 783 253, brin directSHROOM3Schéma de NUP54 : 12 exons sur le brin inverse du chromosome 4Exon 12 : 76 114 664–76 115 494, 831 basesExon 11 : 76 117 664–76 117 774, 111 basesExon 10 : 76 118 075–76 118 194, 120 basesExon 9 : 76 124 649–76 124 756, 108 basesExon 8 : 76 130 656–76 130 749, 94 basesExon 7 : 76 131 230–76 131 284, 55 basesExon 6 : 76 132 523–76 132 719, 197 basesExon 5 : 76 134 175–76 134 362, 188 basesExon 4 : 76 136 186–76 136 412, 227 basesExon 3 : 76 144 149–76 144 292, 144 basesExon 2 : 76 144 390–76 144 473, 84 basesExon 1 : 76 148 308–76 148 397, 90 bases1210864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,2 kb sur les 33,7 kb du gène ; 1 524 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.

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Dante Labs. (s.d.). Gène NUP54 : nucleoporin 54. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/nup54

Vancouver

Dante Labs. Gène NUP54 : nucleoporin 54 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/nup54

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