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Gène

NDST1

N-deacetylase and N-sulfotransferase 1

Résumé

Localisation cytogénétique
5q33.1
Coordonnées
Chromosome 5 : 150 508 131–150 558 211 (GRCh38)
Exons
15 exons sur 50,1 kb
Protéine
882 acides aminés
Aussi appelé
NST1
Symboles précédents
HSST
Transcrit MANE Select
ENST00000261797.7NM_001543.5
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

    Structure de NDST1

    • Séquence codante
    • Région non traduite
    • Intron
    • Sens de la transcription
    • Sites connus associés à une maladie
    • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
    Chromosome 5, avec un crochet à l'emplacement de NDST1. NDST1 et 19 gènes à proximité sur le chromosome 5, de 150 033 171 à 151 033 170.Chromosome 55q33.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3150,2 Mb150,4 Mb150,6 Mb150,8 Mb151 MbHMGXB3 : 150 000 046–150 053 148, brin directHMGXB3CSF1R : 150 053 291–150 113 372, brin inverseCSF1RPDGFRB : 150 113 839–150 186 363, brin inversePDGFRBCDX1 : 150 166 772–150 186 162, brin directCDX1SLC6A7 : 150 190 041–150 222 788, brin directSLC6A7CAMK2A : 150 219 491–150 290 324, brin inverseCAMK2AARSI : 150 296 343–150 339 307, brin inverseARSITCOF1 : 150 357 629–150 400 510, brin directTCOF1CD74 : 150 401 637–150 412 969, brin inverseCD74RPS14 : 150 429 756–150 449 952, brin inverseRPS14NDST1 : 150 508 131–150 558 211, brin directNDST1SYNPO : 150 601 080–150 659 208, brin directSYNPOMYOZ3 : 150 660 450–150 680 022, brin directMYOZ3RBM22 : 150 690 790–150 701 097, brin inverseRBM22DCTN4 : 150 706 840–150 759 095, brin inverseDCTN4SMIM3 : 150 777 883–150 796 736, brin directSMIM3IRGM : 150 846 521–150 900 736, brin directIRGMZNF300 : 150 893 804–150 904 987, brin inverseZNF300GPX3 : 151 020 585–151 030 769, brin directGPX3TNIP1 : 151 029 935–151 093 577, brin inverseTNIP1Schéma de NDST1 : 15 exons sur le brin direct du chromosome 5Exon 3 : 1 site connu associé à une maladieExon 9 : 1 site connu associé à une maladieExon 10 : 1 site connu associé à une maladieExon 1 : 150 508 131–150 508 226, 96 basesExon 2 : 150 520 868–150 521 767, 900 basesExon 3 : 150 527 804–150 528 298, 495 basesExon 4 : 150 532 945–150 533 032, 88 basesExon 5 : 150 534 867–150 535 021, 155 basesExon 6 : 150 535 700–150 535 885, 186 basesExon 7 : 150 539 228–150 539 356, 129 basesExon 8 : 150 540 082–150 540 264, 183 basesExon 9 : 150 541 570–150 541 666, 97 basesExon 10 : 150 542 848–150 542 971, 124 basesExon 11 : 150 545 312–150 545 486, 175 basesExon 12 : 150 548 218–150 548 388, 171 basesExon 13 : 150 549 678–150 549 787, 110 basesExon 14 : 150 551 753–150 551 855, 103 basesExon 15 : 150 553 213–150 558 211, 4 999 bases1234567891011121314155′3′

    Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

    Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

    Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

    Les exons représentent 8 kb sur les 50,1 kb du gène ; 2 649 de ces bases codent pour la protéine.

    Comment un test génomique lit NDST1

    3

    positions dans NDST1 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

    Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

    Un génome entier couvre les 50,1 kb de NDST1, introns compris, et pas seulement les 8 kb d'exons.

    D'où viennent ces informations

    • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
    • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
    • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
    • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
    • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
    • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
    • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

    Citer cette page

    APA

    Dante Labs. (s.d.). Gène NDST1 : N-deacetylase and N-sulfotransferase 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ndst1

    Vancouver

    Dante Labs. Gène NDST1 : N-deacetylase and N-sulfotransferase 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ndst1

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