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Gène

HAMP

hepcidin antimicrobial peptide

Résumé

Localisation cytogénétique
19q13.12
Coordonnées
Chromosome 19 : 35 282 528–35 285 143 (GRCh38)
Exons
3 exons sur 2,6 kb
Protéine
84 acides aminés
Aussi appelé
LEAP-1, HEPC, HFE2B, LEAP1
Transcrit MANE Select
ENST00000222304.5NM_021175.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

  • Hémochromatose

    • Hémochromatose héréditaire

      Un trouble métabolique héréditaire caractérisé par une accumulation de fer dans les tissus.

      • ClinGen classe ce lien comme définitif
      • 5 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
      Ce que la connaissance change

      Saignées (phlébotomies), chélation du fer, régime pauvre en fer, dépistage familial

Structure de HAMP

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
Chromosome 19, avec un crochet à l'emplacement de HAMP. HAMP et 43 gènes à proximité sur le chromosome 19, de 34 783 836 à 35 783 835.Chromosome 1919q13.12p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4334,8 Mb35 Mb35,2 Mb35,4 Mb35,6 MbZNF30 : 34 926 887–34 945 172, brin directZNF30ZNF792 : 34 956 167–34 964 293, brin inverseZNF792GRAMD1A : 34 994 537–35 027 406, brin directGRAMD1ASCN1B : 35 030 444–35 040 455, brin directSCN1BHPN : 35 040 506–35 066 592, brin directHPN : 35 106 510–35 124 297, brin directFXYD3 : 35 115 521–35 125 653, brin directLGI4 : 35 124 507–35 142 451, brin inverseLGI4FXYD1 : 35 133 987–35 143 109, brin directFXYD1FXYD7 : 35 143 148–35 154 303, brin directFXYD7FXYD5 : 35 154 440–35 171 796, brin directFXYD5FAM187B : 35 224 800–35 228 739, brin inverseFAM187BLSR : 35 248 330–35 267 967, brin directLSRUSF2 : 35 268 485–35 279 821, brin directUSF2HAMP : 35 282 528–35 285 143, brin directHAMPMAG : 35 291 647–35 316 932, brin directMAGCD22 : 35 319 261–35 347 361, brin directCD22FFAR1 : 35 347 902–35 353 864, brin directFFAR1FFAR3 : 35 358 348–35 360 489, brin directFFAR3GPR42 : 35 371 068–35 372 962, brin directGPR42FFAR2 : 35 443 907–35 451 767, brin directFFAR2KRTDAP : 35 487 324–35 495 558, brin inverseKRTDAPDMKN : 35 497 220–35 513 704, brin inverseDMKNSBSN : 35 523 367–35 528 351, brin inverseSBSNGAPDHS : 35 533 455–35 545 319, brin directGAPDHSTMEM147 : 35 545 600–35 547 527, brin directATP4A : 35 549 339–35 563 658, brin inverseATP4APMIS2 : 35 586 161–35 587 296, brin directPMIS2HAUS5 : 35 612 735–35 625 355, brin directHAUS5RBM42 : 35 628 989–35 638 927, brin directRBM42ETV2 : 35 641 730–35 644 871, brin directETV2COX6B1 : 35 648 230–35 662 890, brin directCOX6B1UPK1A : 35 666 516–35 678 481, brin directUPK1AZBTB32 : 35 704 558–35 717 048, brin directZBTB32KMT2B : 35 717 973–35 738 880, brin directKMT2BIGFLR1 : 35 738 798–35 742 459, brin inverseIGFLR1 : 35 739 252–35 745 432, brin inverseU2AF1L4 : 35 742 464–35 745 460, brin inversePSENEN : 35 745 070–35 747 519, brin direct : 35 745 678–35 754 519, brin directLIN37 : 35 748 361–35 754 519, brin directHSPB6 : 35 754 566–35 758 079, brin inversePROSER3 : 35 758 143–35 771 398, brin directARHGAP33 : 35 774 532–35 788 822, brin directSchéma de HAMP : 3 exons sur le brin direct du chromosome 19Exon 1 : 1 site connu associé à une maladieExon 3 : 2 sites connus associés à une maladieExon 1 : 35 282 528–35 282 667, 140 basesExon 2 : 35 284 789–35 284 848, 60 basesExon 3 : 35 284 938–35 285 143, 206 bases1235′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 0,4 kb sur les 2,6 kb du gène ; 255 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit HAMP

3

positions dans HAMP où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 2,6 kb de HAMP, introns compris, et pas seulement les 0,4 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
  • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gène HAMP : hepcidin antimicrobial peptide. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/hamp

Vancouver

Dante Labs. Gène HAMP : hepcidin antimicrobial peptide [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/hamp

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