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Gène

LGI4

leucine rich repeat LGI family member 4

Résumé

Localisation cytogénétique
19q13.12
Coordonnées
Chromosome 19 : 35 124 513–35 135 059 (GRCh38)
Exons
9 exons sur 10,5 kb
Protéine
537 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000310123.8NM_139284.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore LGI4. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de LGI4

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 19, avec un crochet à l'emplacement de LGI4. LGI4 et 33 gènes à proximité sur le chromosome 19, de 34 629 786 à 35 629 785.Chromosome 1919q13.12p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4334,8 Mb35 Mb35,2 Mb35,4 Mb35,6 MbSCGB2B2 : 34 590 644–34 677 159, brin inverseSCGB2B2ZNF302 : 34 677 084–34 687 065, brin directZNF302ZNF181 : 34 734 155–34 750 437, brin directZNF181ZNF599 : 34 758 073–34 773 253, brin inverseZNF599ZNF30 : 34 926 887–34 945 172, brin directZNF30ZNF792 : 34 956 167–34 964 293, brin inverseZNF792GRAMD1A : 34 994 537–35 027 406, brin directGRAMD1ASCN1B : 35 030 444–35 040 455, brin directSCN1BHPN : 35 040 506–35 066 592, brin directHPN : 35 106 510–35 124 297, brin directFXYD3 : 35 115 521–35 125 653, brin directFXYD3LGI4 : 35 124 513–35 135 059, brin inverseLGI4FXYD1 : 35 133 987–35 143 109, brin directFXYD1FXYD7 : 35 143 148–35 154 303, brin directFXYD5 : 35 154 440–35 171 796, brin directFXYD5FAM187B : 35 224 800–35 228 739, brin inverseFAM187BLSR : 35 248 330–35 267 967, brin directLSRUSF2 : 35 268 485–35 279 821, brin directUSF2HAMP : 35 280 716–35 285 146, brin directHAMPMAG : 35 291 647–35 316 932, brin directMAGCD22 : 35 319 261–35 347 361, brin directCD22FFAR1 : 35 347 902–35 353 864, brin directFFAR1FFAR3 : 35 358 348–35 360 489, brin directFFAR3GPR42 : 35 371 068–35 372 962, brin directGPR42FFAR2 : 35 443 907–35 451 767, brin directFFAR2KRTDAP : 35 487 324–35 495 558, brin inverseKRTDAPDMKN : 35 497 220–35 513 704, brin inverseDMKNSBSN : 35 523 367–35 528 351, brin inverseSBSNGAPDHS : 35 533 455–35 545 319, brin directGAPDHSTMEM147 : 35 545 600–35 547 527, brin directATP4A : 35 549 339–35 563 658, brin inverseATP4APMIS2 : 35 586 161–35 587 296, brin directPMIS2HAUS5 : 35 612 735–35 625 355, brin directHAUS5RBM42 : 35 628 989–35 638 927, brin directRBM42Schéma de LGI4 : 9 exons sur le brin inverse du chromosome 19Exon 8 : 4 sites connus associés à une maladieExon 7 : 1 site connu associé à une maladieExon 6 : 1 site connu associé à une maladieExon 5 : 1 site connu associé à une maladieExon 3 : 2 sites connus associés à une maladieExon 9 : 35 124 513–35 125 507, 995 basesExon 8 : 35 126 270–35 126 775, 506 basesExon 7 : 35 126 853–35 127 017, 165 basesExon 6 : 35 131 386–35 131 555, 170 basesExon 5 : 35 131 789–35 131 860, 72 basesExon 4 : 35 131 971–35 132 042, 72 basesExon 3 : 35 133 693–35 133 764, 72 basesExon 2 : 35 134 033–35 134 104, 72 basesExon 1 : 35 134 511–35 135 059, 549 bases9876543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,7 kb sur les 10,5 kb du gène ; 1 614 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit LGI4

9

positions dans LGI4 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 10,5 kb de LGI4, introns compris, et pas seulement les 2,7 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène LGI4 : leucine rich repeat LGI family member 4. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/lgi4

Vancouver

Dante Labs. Gène LGI4 : leucine rich repeat LGI family member 4 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/lgi4

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