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Gène

CDAN1

codanin 1

Résumé

Localisation cytogénétique
15q15.2
Coordonnées
Chromosome 15 : 42 723 544–42 737 128 (GRCh38)
Exons
28 exons sur 13,6 kb
Protéine
1 227 acides aminés
Aussi appelé
CDA-I, CDAI
Transcrit MANE Select
ENST00000356231.4NM_138477.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

  • Anémies dyserythropoïétiques congénitales

    • Anémie dyserythropoïétique congénitale

      Groupe de maladies (types I à IV et formes apparentées) causées par des modifications de gènes tels que CDAN1, CDIN1, SEC23B, KIF23, KLF1 et GATA1, most souvent transmises selon un mode autosomique récessif, avec quelques formes dominantes.

      • ClinGen classe ce lien comme définitif
      • 3 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
      Ce que la connaissance change

      Un diagnostic permet d'orienter la surveillance et le traitement de la surcharge en fer, qui peut apparaître même en l'absence de transfusions ; l'interféron alpha peut être utile dans le type I.

Structure de CDAN1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
Chromosome 15, avec un crochet à l'emplacement de CDAN1. CDAN1 et 16 gènes à proximité sur le chromosome 15, de 42 230 336 à 43 230 335.Chromosome 1515q15.2p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q14q15.1q15.2q15.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26.1q26.2q26.342,4 Mb42,6 Mb42,8 Mb43 Mb43,2 MbTMEM87A : 42 209 667–42 274 128, brin inverseTMEM87AGANC : 42 273 196–42 353 666, brin directGANC : 42 348 103–42 412 317, brin directCAPN3 : 42 359 494–42 412 949, brin directCAPN3ZNF106 : 42 412 823–42 491 150, brin inverseZNF106SNAP23 : 42 491 233–42 545 358, brin directSNAP23 : 42 497 395–42 548 786, brin inverseLRRC57 : 42 534 627–42 548 802, brin inverseLRRC57HAUS2 : 42 548 828–42 572 263, brin directHAUS2STARD9 : 42 575 574–42 720 998, brin directSTARD9CDAN1 : 42 723 544–42 737 128, brin inverseCDAN1TTBK2 : 42 738 730–42 920 850, brin inverseTTBK2UBR1 : 42 942 897–43 106 141, brin inverseUBR1TMEM62 : 43 123 279–43 185 144, brin directTMEM62 : 43 179 715–43 206 481, brin inverseCCNDBP1 : 43 185 118–43 197 177, brin directCCNDBP1EPB42 : 43 191 351–43 221 053, brin inverseEPB42Schéma de CDAN1 : 28 exons sur le brin inverse du chromosome 15Exon 26 : 3 sites connus associés à une maladieExon 24 : 2 sites connus associés à une maladieExon 21 : 1 site connu associé à une maladieExon 20 : 1 site connu associé à une maladieExon 19 : 1 site connu associé à une maladieExon 18 : 1 site connu associé à une maladieExon 17 : 1 site connu associé à une maladieExon 16 : 1 site connu associé à une maladieExon 14 : 6 sites connus associés à une maladieExon 12 : 2 sites connus associés à une maladieExon 11 : 2 sites connus associés à une maladieExon 7 : 1 site connu associé à une maladieExon 6 : 1 site connu associé à une maladieExon 5 : 1 site connu associé à une maladieExon 4 : 2 sites connus associés à une maladieExon 2 : 5 sites connus associés à une maladieExon 28 : 42 723 544–42 724 616, 1 073 basesExon 27 : 42 725 144–42 725 251, 108 basesExon 26 : 42 725 489–42 725 670, 182 basesExon 25 : 42 726 097–42 726 160, 64 basesExon 24 : 42 726 310–42 726 417, 108 basesExon 23 : 42 727 621–42 727 769, 149 basesExon 22 : 42 727 955–42 728 033, 79 basesExon 21 : 42 728 204–42 728 267, 64 basesExon 20 : 42 728 652–42 728 810, 159 basesExon 19 : 42 729 023–42 729 126, 104 basesExon 18 : 42 729 229–42 729 362, 134 basesExon 17 : 42 729 568–42 729 622, 55 basesExon 16 : 42 729 796–42 729 885, 90 basesExon 15 : 42 730 128–42 730 215, 88 basesExon 14 : 42 730 598–42 730 764, 167 basesExon 13 : 42 730 925–42 731 071, 147 basesExon 12 : 42 731 211–42 731 331, 121 basesExon 11 : 42 731 620–42 731 825, 206 basesExon 10 : 42 732 333–42 732 408, 76 basesExon 9 : 42 733 097–42 733 186, 90 basesExon 8 : 42 733 938–42 734 047, 110 basesExon 7 : 42 734 226–42 734 346, 121 basesExon 6 : 42 735 100–42 735 178, 79 basesExon 5 : 42 735 261–42 735 374, 114 basesExon 4 : 42 735 510–42 735 679, 170 basesExon 3 : 42 735 875–42 736 078, 204 basesExon 2 : 42 736 302–42 736 780, 479 basesExon 1 : 42 737 013–42 737 128, 116 bases28262422201816141210864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4,7 kb sur les 13,6 kb du gène ; 3 684 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit CDAN1

34

positions dans CDAN1 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 13,6 kb de CDAN1, introns compris, et pas seulement les 4,7 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
  • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gène CDAN1 : codanin 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/cdan1

Vancouver

Dante Labs. Gène CDAN1 : codanin 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/cdan1

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