Geeni
TFAM
transcription factor A, mitochondrial
- HGNC 11741↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000108064↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 7019↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 10q21.1
- Koordinaatit
- Kromosomi 10: 58 385 410–58 399 220 (GRCh38)
- Eksonit
- 7 eksonia 13,8 kb:n alueella
- Proteiini
- 246 aminohappoa
- Aiemmat symbolit
- TCF6, TCF6L2
- MANE Select -transkripti
- ENST00000487519.6NM_003201.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue TFAM ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Primaarinen mitokondriosairaus
- Mitokondrion DNA:n vähenemän oireyhtymä
Aiheuttajina ovat tumagenomin geenien, kuten POLG, TWNK, TK2, DGUOK, MPV17, RRM2B ja SUCLA2, variantit. Ne vähentävät mitokondrion DNA:n määrää ja voivat aiheuttaa lihas-, maksa- tai aivosairauden.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Tieto on suoraan hyödynnettävissä: POLG-sairaudessa valproaattia on vältettävä, koska se voi aiheuttaa hengenvaarallisen maksavaurion, ja TK2-puutokseen on olemassa nukleosidihoito.
TFAM-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 5 kb geenin 13,8 kb:stä; 741 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä TFAM
2
TFAM-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 13,8 kb geenistä TFAM, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 5 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- AFG3L2AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2Yhteinen sairaus: 1
- AGKacylglycerol kinaseYhteinen sairaus: 1
- DGUOKdeoxyguanosine kinaseYhteinen sairaus: 1
- DNA2DNA replication helicase/nuclease 2Yhteinen sairaus: 1
- FBXL4F-box and leucine rich repeat protein 4Yhteinen sairaus: 1
- GUK1guanylate kinase 1Yhteinen sairaus: 1
- LIG3DNA ligase 3Yhteinen sairaus: 1
- MGME1mitochondrial genome maintenance exonuclease 1Yhteinen sairaus: 1
- MPV17mitochondrial inner membrane protein MPV17Yhteinen sairaus: 1
- MRM2mitochondrial rRNA methyltransferase 2Yhteinen sairaus: 1
- OPA1OPA1 mitochondrial dynamin like GTPaseYhteinen sairaus: 1
- POLGDNA polymerase gamma, catalytic subunitYhteinen sairaus: 1
Geeniin TFAM liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita TFAM voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). TFAM-geeni: transcription factor A, mitochondrial. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/tfam
Dante Labs. TFAM-geeni: transcription factor A, mitochondrial [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/tfam
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa