Geeni
NLGN4X
neuroligin 4 X-linked
- HGNC 14287↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000146938↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 57502↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- Xp22.32-p22.31
- Koordinaatit
- Kromosomi X: 5 890 042–6 228 867 (GRCh38)
- Eksonit
- 6 eksonia 338,8 kb:n alueella
- Proteiini
- 816 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- KIAA1260, NLGN, HLNX
- Aiemmat symbolit
- NLGN4
- MANE Select -transkripti
- ENST00000381095.8NM_181332.3
- Lokustyyppi
- Proteiinia koodaava
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/nlgn4x.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue NLGN4X ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Autismispektrumhäiriö
- Autismi, alttius (yksittäisgeenimuodot)
Yksittäisten geenien vaikutus autismiin, mukaan lukien variantit geeneissä NLGN3, NLGN4X, PTCHD1, SHANK2, TBR1 ja CHD8.
- 4 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
Epilepsia (laaja paneeli)
- X-kromosomaalisesti periytyvä monimutkainen neurokehityksellinen häiriö
Monimutkainen neurokehityksellinen häiriö, joka periytyy X-kromosomaalisesti ja jonka tunnusomaisia piirteitä ovat älyllinen kehitysvammaisuus, autismi ja epilepsia.
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: varma
- 1 GenCC-arvioija pitää sitä varmana tai vahvana
NLGN4X-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 5,9 kb geenin 338,8 kb:stä; 2 451 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
NLGN4X-geenin sekvensointi
2
kohtaa NLGN4X-geenissä, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Yksikään niistä ei osu alueelle, jolla lyhyet luennat ovat vaikeita.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 338,8 kb NLGN4X-geenistä, intronit mukaan lukien, eikä pelkästään 5,9 kb eksoneita.
ClinVar pathogenic variants (2)
The NLGN4X variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogeeninen 1
- Todennäköisesti patogeeninen 1
| Variantti | Conditions | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|
| NM_181332.3(NLGN4X):c.779_782dup (p.Leu262fs) (opens in a new tab) | autism, susceptibility to, X-linked 2 | Patogeeninen | ★★★★1 tähti neljästä kriteerit annettu, yksi lähettäjä |
| NM_181332.3(NLGN4X):c.626-1G>A (opens in a new tab) | autism, susceptibility to, X-linked 2 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★1 tähti neljästä kriteerit annettu, yksi lähettäjä |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- NLGN3neuroligin 3Yhteisiä sairauksia: 2
- PTCHD1patched domain containing 1Yhteisiä sairauksia: 2
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Yhteinen sairaus: 1
- ARXaristaless related homeoboxYhteinen sairaus: 1
- CHD8chromodomain helicase DNA binding protein 8Yhteinen sairaus: 1
- CLCN4Cl-/H+ antiporter 4Yhteinen sairaus: 1
- CNKSR2connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2Yhteinen sairaus: 1
- FRMPD4FERM and PDZ domain containing 4Yhteinen sairaus: 1
- FTSJ1FtsJ RNA 2'-O-methyltransferase 1Yhteinen sairaus: 1
- GRIA3glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3Yhteinen sairaus: 1
- HNRNPH2heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2Yhteinen sairaus: 1
- IL1RAPL1interleukin 1 receptor accessory protein like 1Yhteinen sairaus: 1
Geeniin NLGN4X liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita NLGN4X voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tiedot ovat peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-18: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut sairauksia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joita lyhyet lukemat pitävät vaikeina.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Tietojulkaisu 2026.10.18-8b139e39.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). NLGN4X-geeni: neuroligin 4 X-linked. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/nlgn4x
Dante Labs. NLGN4X-geeni: neuroligin 4 X-linked [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/nlgn4x
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa