Geeni
GNPAT
glyceronephosphate O-acyltransferase
- HGNC 4416↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000116906↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 8443↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 1q42.2
- Koordinaatit
- Kromosomi 1: 231 241 212–231 277 973 (GRCh38)
- Eksonit
- 16 eksonia 36,8 kb:n alueella
- Proteiini
- 680 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- DHAPAT, DAPAT, DAP-AT
- MANE Select -transkripti
- ENST00000366647.9NM_014236.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue GNPAT ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Peroksisomien entsyymihäiriöt ja Refsumin tauti
- Glyseronefosfaatti-O-asyylitransferaasin puutosAutosomaalinen resessiivinen
Aiheutuu GNPAT-geenin variantеista, jotka heikentävät plasmalogeenien tuotantoa ja aiheuttavat rhizomelisen kondrodysplasia punctata -tyypin 2, johon liittyy lyhyet raajat, kaihi ja kehityksen viivästymistä.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Tieto voi päättää diagnoosin etsimisen ja ohjata tukihoitoa sekä perhesuunnittelua.
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
GNPAT-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 2,6 kb geenin 36,8 kb:stä; 2 043 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä GNPAT
39
GNPAT-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 36,8 kb geenistä GNPAT, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 2,6 kb eksoneja.
Geeniin GNPAT liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita GNPAT voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of head or neck
- Midface retrusion
- Submucous cleft hard palate
- Abnormally small head
- Depressed nasal bridge
- High forehead
- High palate
- Little lower jaw
- Nasal tip, upturned
Näytä 2 piirrettä lisää
Abnormality of the musculoskeletal system
- Coronal cleft vertebrae
- Low muscle tone
- Speckled calcifications in end part of bone
- Abnormal shape of pelvic girdle bone
- Calcific stippling
- Flexed joint that cannot be straightened
- Generalized decreased muscle tone
- Irregular vertebral endplates
Näytä 2 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). GNPAT-geeni: glyceronephosphate O-acyltransferase. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/gnpat
Dante Labs. GNPAT-geeni: glyceronephosphate O-acyltransferase [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/gnpat
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa