Geeni
FOXC2
forkhead box C2
- HGNC 3801↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000176692↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 2303↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 16q24.1
- Koordinaatit
- Kromosomi 16: 86 566 829–86 569 728 (GRCh38)
- Eksonit
- 1 eksoni 2,9 kb:n alueella
- Proteiini
- 501 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Tunnetaan myös nimellä
- MFH-1
- Aiemmat symbolit
- FKHL14
- MANE Select -transkripti
- ENST00000649859.1NM_005251.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue FOXC2 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Ensisijainen lymfedeema ja lymfaattiset malformaatiot
- Lymfedeema-distichiasis-oireyhtymäAutosomaalinen dominantti
FOXC2-geenin muutosten aiheuttama sairaus, joka aiheuttaa jalkojen turvotusta murrosiästä alkaen sekä ylimääräisen silmäripsirivin, joskus myös suonikohjuja, luomiputoamista tai sydänvikoja.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 5 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Tiedosta on hyötyä kompressiohoidossa sekä silmä- ja sydäntarkastuksissa.
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
FOXC2-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 2,9 kb geenin 2,9 kb:stä; 1 506 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä FOXC2
23
FOXC2-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Niistä 3 (13 %) osuu alueille, joita lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
- Low mappability (3 kohtaa)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Kokogenomi kattaa kaikki 2,9 kb geenistä FOXC2, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 2,9 kb eksoneja.
Geeniin FOXC2 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita FOXC2 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). FOXC2-geeni: forkhead box C2. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/foxc2
Dante Labs. FOXC2-geeni: forkhead box C2 [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/foxc2
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa