Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

LTA

lymphotoxin alpha

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
6p21.33
Koordinaadid
Kromosoom 6: 31 572 289–31 574 324 (GRCh38)
Eksonid
4 eksonit, ulatus 2 kb
Valk
205 aminohapet
Tuntud ka kui
TNFSF1, LT
Varasemad tähised
TNFB
MANE Select transkript
ENST00000418386.3NM_000595.4
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni LTA veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas LTA on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 6, millel on sulg kohal, kus asub LTA. LTA ja sellele lähedal asuvad 64 geeni kromosoomil 6, vahemikus 31 073 307 kuni 32 073 306.Kromosoom 66p21.33p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2731,2 Mb31,4 Mb31,6 Mb31,8 Mb32 MbC6orf15: 31 111 223–31 112 582, pöördne ahelPSORS1C1: 31 114 750–31 140 092, otsene ahelCDSN: 31 115 087–31 120 446, pöördne ahelPSORS1C2: 31 137 534–31 139 721, pöördne ahelPSORS1C2CCHCR1: 31 142 439–31 158 238, pöördne ahelCCHCR1TCF19: 31 158 331–31 167 252, otsene ahelTCF19POU5F1: 31 163 193–31 180 731, pöördne ahelPOU5F1HLA-C: 31 268 746–31 272 171, pöördne ahelHLA-CHLA-B: 31 353 195–31 367 067, pöördne ahelHLA-BMICA: 31 399 784–31 415 315, otsene ahelMICAMICB: 31 494 881–31 511 124, otsene ahelMICBMCCD1: 31 528 962–31 530 232, otsene ahelMCCD1DDX39B: 31 530 217–31 542 451, pöördne ahelATP6V1G2-DDX39B: 31 530 219–31 546 608, pöördne ahelATP6V1G2: 31 544 444–31 548 427, pöördne ahelNFKBIL1: 31 546 870–31 558 829, otsene ahelLTA: 31 572 289–31 574 324, otsene ahelLTATNF: 31 575 558–31 578 336, otsene ahelTNFLTB: 31 580 525–31 582 522, pöördne ahelLTBLST1: 31 581 065–31 588 911, otsene ahelLST1NCR3: 31 588 895–31 593 217, pöördne ahelAIF1: 31 615 214–31 617 025, otsene ahelPRRC2A: 31 620 675–31 637 771, otsene ahel: 31 622 774–31 622 860, otsene ahel: 31 623 874–31 625 499, otsene ahelBAG6: 31 638 543–31 652 747, pöördne ahelBAG6APOM: 31 652 416–31 658 214, otsene ahelAPOMC6orf47: 31 658 298–31 660 778, pöördne ahelGPANK1: 31 661 228–31 666 283, pöördne ahelGPANK1CSNK2B: 31 665 227–31 670 343, otsene ahel: 31 666 102–31 673 546, otsene ahelLY6G5B: 31 669 976–31 673 776, otsene ahelLY6G5C: 31 676 684–31 684 040, pöördne ahelABHD16A: 31 686 954–31 703 391, pöördne ahelLY6G6F: 31 706 863–31 710 801, otsene ahelLY6G6FLY6G6F-LY6G6D: 31 706 904–31 717 918, otsene ahelLY6G6D: 31 715 285–31 717 919, otsene ahelLY6G6DMPIG6B: 31 718 594–31 726 714, otsene ahelLY6G6C: 31 718 648–31 721 746, pöördne ahelDDAH2: 31 726 586–31 730 617, pöördne ahelCLIC1: 31 730 579–31 740 558, pöördne ahelMSH5: 31 739 677–31 762 678, otsene ahelMSH5-SAPCD1: 31 740 020–31 764 851, otsene ahelSAPCD1: 31 762 656–31 764 851, otsene ahelVWA7: 31 765 590–31 777 328, pöördne ahelVWA7VARS1: 31 777 518–31 795 975, pöördne ahelLSM2: 31 797 019–31 806 992, pöördne ahelLSM2HSPA1L: 31 809 619–31 815 788, pöördne ahelHSPA1LHSPA1A: 31 815 543–31 817 994, otsene ahelHSPA1B: 31 827 738–31 830 254, otsene ahelHSPA1BNEU1: 31 857 063–31 862 905, pöördne ahelNEU1SLC44A4: 31 863 173–31 879 198, pöördne ahelSLC44A4EHMT2: 31 879 758–31 897 723, pöördne ahelEHMT2C2: 31 897 785–31 945 677, otsene ahelC2ZBTB12: 31 899 065–31 902 103, pöördne ahelZBTB12: 31 927 698–31 952 048, otsene ahelCFB: 31 945 650–31 952 086, otsene ahelCFBNELFE: 31 952 087–31 959 079, pöördne ahelSKIC2: 31 959 025–31 969 852, otsene ahelSKIC2DXO: 31 969 810–31 972 517, pöördne ahelWHR1: 31 971 091–31 982 821, otsene ahelC4A: 31 981 991–32 005 247, otsene ahelC4AC4B: 32 014 725–32 035 975, otsene ahelC4BCYP21A2: 32 038 297–32 042 321, otsene ahelCYP21A2TNXB: 32 041 153–32 115 334, pöördne ahelTNXBLTA skeem: 4 eksonit kromosoomi 6 otsene ahelalEkson 1: 31 572 289–31 572 446, 158 alustEkson 2: 31 572 734–31 572 841, 108 alustEkson 3: 31 572 928–31 573 033, 106 alustEkson 4: 31 573 281–31 574 324, 1044 alust12345′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 1,4 kb kogupikkusega 2 kb; neist 618 alust kodeerivad valku.

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). LTA geen: lymphotoxin alpha. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/lta

Vancouver

Dante Labs. LTA geen: lymphotoxin alpha [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/lta

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test