Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

MMP2

matrix metallopeptidase 2

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
16q12.2
Koordinaadid
Kromosoom 16: 55 479 198–55 506 691 (GRCh38)
Eksonid
13 eksonit, ulatus 27,5 kb
Valk
660 aminohapet
Tuntud ka kui
MMP-2, TBE-1
Varasemad tähised
CLG4, CLG4A
MANE Select transkript
ENST00000219070.9NM_004530.6
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni MMP2 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas MMP2 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 16, millel on sulg kohal, kus asub MMP2. MMP2 ja sellele lähedal asuvad 6 geeni kromosoomil 16, vahemikus 54 992 945 kuni 55 992 944.Kromosoom 1616q12.2p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.355 Mb55,2 Mb55,4 Mb55,6 Mb55,8 MbIRX6: 55 323 974–55 330 769, otsene ahelIRX6MMP2: 55 479 198–55 506 691, otsene ahelMMP2LPCAT2: 55 508 994–55 586 666, otsene ahelLPCAT2CAPNS2: 55 566 684–55 567 687, otsene ahelCAPNS2SLC6A2: 55 655 961–55 707 645, otsene ahelSLC6A2CES1: 55 802 845–55 833 337, pöördne ahelCES1CES5A: 55 846 154–55 956 031, pöördne ahelCES5AMMP2 skeem: 13 eksonit kromosoomi 16 otsene ahelalEkson 2: 3 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 3: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 5: 3 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 6: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 7: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 8: 3 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 9: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 10: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 11: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 1: 55 479 198–55 479 632, 435 alustEkson 2: 55 482 909–55 483 135, 227 alustEkson 3: 55 484 016–55 484 164, 149 alustEkson 4: 55 485 299–55 485 427, 129 alustEkson 5: 55 485 604–55 485 777, 174 alustEkson 6: 55 488 543–55 488 716, 174 alustEkson 7: 55 489 651–55 489 824, 174 alustEkson 8: 55 491 801–55 491 956, 156 alustEkson 9: 55 493 158–55 493 293, 136 alustEkson 10: 55 496 926–55 497 062, 137 alustEkson 11: 55 498 289–55 498 448, 160 alustEkson 12: 55 502 779–55 502 888, 110 alustEkson 13: 55 505 339–55 506 691, 1353 alust124681012135′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 3,5 kb kogupikkusega 27,5 kb; neist 1983 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse MMP2

16

kohad geenis MMP2, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni MMP2 27,5 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (3,5 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). MMP2 geen: matrix metallopeptidase 2. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/mmp2

Vancouver

Dante Labs. MMP2 geen: matrix metallopeptidase 2 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/mmp2

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test