AtlasΓονίδιο
LIAS
lipoic acid synthetase
- HGNC 16429↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- Γονίδιο Ensembl ENSG00000121897↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- NCBI Gene 11019↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
Σύνοψη
- Κυτογενετική θέση
- 4p14
- Συντεταγμένες
- Χρωμόσωμα 4: 39.459.056–39.479.506 (GRCh38)
- Εξόνια
- 11 έξώνια σε 20,5 kb
- Πρωτεΐνη
- 372 αμινοξέα
- Γνωστό επίσης ως
- LAS
- Μεταγράφημα MANE Select
- ENST00000640888.2NM_006859.4
- Τύπος locus
- Κωδικοποιητικά πρωτεΐνες
- Πολύ υψηλή
- Υψηλή
- Χαμηλή
- Πολύ χαμηλή
AtlasΑυτή η σελίδα ως δεδομένα
Προσθέστε .json στη διεύθυνση της σελίδας ή ζητήστε application/json, για να τη διαβάσετε ως JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/lias.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameΔιαβάστε το LIAS, και το υπόλοιπο γονιδίωμά σας, με μία εξέταση.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες
Αποκτήστε το Genome Test σαςΕπιμελημένη αναφορά που σχετίζεται με αυτό το γονίδιο
Ανεπάρκεια Πυρουβικής Αφυδρογονάσης & Πυρουβικής Καρβοξυλάσης
- Ανεπάρκεια Πυρουβικής ΑφυδρογονάσηςΑυτοσωμικός υπολειπόμενος
Προκαλείται από παραλλαγές στο PDHA1 (συνδεδεμένη με το X χρωμόσωμα, συχνά νέα στο παιδί) ή στα PDHB, DLAT, PDHX, DLD, PDP1 ή LIAS, οι οποίες μπορούν να προκαλέσουν γαλακτική οξέωση, καθυστέρηση ανάπτυξης, σπασμούς και κινητικά προβλήματα.
- 4 υποβολείς του GenCC την αξιολογούν ως οριστική ή ισχυρή
▶Δυνατότητα δράσης
Η γνώση επιτρέπει τη χρήση κετογονικής δίαιτας, την αποφυγή μεγάλων φορτίων υδατανθράκων και τη θειαμίνη για τις ανταποκρινόμενες μορφές.
Πώς είναι διαταγμένο το LIAS
- Κωδικοποιούσα αλληλουχία
- Μη μεταφραζόμενη περιοχή
- Ιντρόνιο
- Κατεύθυνση μεταγραφής
- Γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο
- Περιοχές που τα σύντομα αναγνώσματα βρίσκουν δύσκολες
Εξόνια του μεταγράφηματος MANE Select του γονιδίου (έκδοση v1.5), από τα NCBI και το EMBL-EBI, στο γονιδίωμα αναφοράς GRCh38.
Ζώνες χρωμοσωμάτων από το ιδεόγραμμα GRCh38 του UCSC (2022-10-29).
Γειτονικά γονίδια από την έκδοση 116 του Ensembl, στο GRCh38.
Τα εξόνια αποτελούν 3,6 kb από τα 20,5 kb του γονιδίου· 1.119 από αυτές τις βάσεις κωδικοποιούν την πρωτεΐνη.
Αλληλούχιση του LIAS
1Χαμηλή
Πόσο δύσκολο είναι να αλληλουχηθεί το LIAS με σύντομα αναγνώσματα, από το 100Κάθε ράβδος δείχνει το μερίδιο των βάσεων των εξονίων του LIAS που βρίσκονται σε αυτό το είδος δύσκολης περιοχής. Η βαθμολογία σταθμίζει τις ράβδους ανάλογα με το πόσο δυσκολεύει κάθε μία μια κλήση με βραχείες αναγνώσεις: 0 όταν καμία βάση δεν βρίσκεται σε καμία από αυτές, 100 όταν κάθε βάση βρίσκεται σε όλες.
- ΧαρτογραφησιμότηταΤμήματα όπου αναγνώσματα των 100 ή 250 bp δεν μπορούν να τοποθετηθούν μοναδικά, οπότε μια κλήση εκεί μπορεί να λείπει ή να είναι εσφαλμένη. Βάρος 35%.0,4%
- ΟμολογίαΤμηματικές διπλασιάσεις: αντίγραφα αλλού στο γονιδίωμα, όπως παραλόγοι και ψευδογονίδια, με ταυτότητα 90% ή μεγαλύτερη. Βάρος 30%.0%
- ΕπαναλήψειςΕν σειρά επαναλήψεις και σειρές ενός βάσης, στις οποίες τα αναγνώσματα γλιστρούν και ενδέχεται να μην τις καλύπτουν. Βάρος 15%.7,1%
- Περιεκτικότητα σε GCΠεριοχές με λιγότερο από 25% ή περισσότερο από 65% G και C, τις οποίες η προετοιμασία βιβλιοθήκης καλύπτει ελάχιστα. Βάρος 10%.0%
- Κάλυψη αναφοράςΚενά στο τοπικό σύνολο αναφοράς, όπου δεν υπάρχει αλληλουχία με την οποία να ευθυγραμμίζονται οι αναγνώσεις. Βάρος 10%.0%
26
θέσεις στο LIAS όπου το ClinVar κατατάσσει μια μεταβολή ως παθογόνο ή πιθανώς παθογόνο
Καμία από αυτές δεν βρίσκεται σε περιοχή που τα σύντομα αναγνώσματα δυσκολεύονται να εντοπίσουν.
Μια ολόκληρη αλληλούχιση γονιδιώματος καλύπτει και τα 20,5 kb του LIAS, συμπεριλαμβανομένων των ιντρονίων, και όχι μόνο τα 3,6 kb των εξονίων.
Γονίδια που σχετίζονται με τις ίδιες παθήσεις
- DLATdihydrolipoamide S-acetyltransferaseΜοιράζεται 1 πάθηση
- DLDdihydrolipoamide dehydrogenaseΜοιράζεται 1 πάθηση
- PDHA1pyruvate dehydrogenase E1 subunit alpha 1Μοιράζεται 1 πάθηση
- PDHBpyruvate dehydrogenase E1 subunit betaΜοιράζεται 1 πάθηση
- PDHXpyruvate dehydrogenase complex component XΜοιράζεται 1 πάθηση
- PDP1pyruvate dehydrogenase phosphatase catalytic subunit 1Μοιράζεται 1 πάθηση
Χαρακτηριστικά που συνδέονται με το LIAS
Το Human Phenotype Ontology καταγράφει αυτά ως χαρακτηριστικά των σπάνιων παθήσεων που μπορεί να προκαλέσει το LIAS. Η σελίδα κάθε χαρακτηριστικού εμφανίζει τα άλλα γονίδια που συνδέονται με αυτό.
Εξωτερικοί σύνδεσμοι
Εγγραφές γονιδίου
Μεταγράφημα
Πρωτεΐνη
Από πού προέρχονται αυτά
- HGNC: το σύμβολο, το όνομα, τα άλλα σύμβολα και η θέση του γονιδίου.
- MANE Select v1.5, από NCBI και EMBL-EBI: το μεταγράφημα, τα εξόνιά του και η κωδικοποιούσα αλληλουχία.
- GenCC και ClinGen, έκδοση 2026-10-17: ποιες παθήσεις συνδέονται με το γονίδιο και πόσο ισχυρή είναι αυτή η σύνδεση.
- Η λίστα δευτερευόντων ευρημάτων του ACMG, SF v3.2.
- ClinVar και οι στρωματοποιήσεις GIAB: γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο, και οι περιοχές που οι βραχείες αναγνώσεις βρίσκουν δύσκολες.
- Οι στρωματοποιήσεις γονιδιώματος Genome in a Bottle, από το NIST: η βαθμολογία δυσκολίας αλληλούχισης.
- Το Human Phenotype Ontology, έκδοση 2026-09-01: τα χαρακτηριστικά που συνδέονται με το γονίδιο. Μάθετε περισσότερα στο hpo.jax.org.
- Έκδοση δεδομένων 2026.10.17-8666dff2.
Παραπομπή σε αυτή τη σελίδα
Dante Labs. (χ.η.). Γονίδιο LIAS: lipoic acid synthetase. Ανάκτηση 17 Οκτωβρίου 2026, από https://dantelabs.com/el/genes/lias
Dante Labs. Γονίδιο LIAS: lipoic acid synthetase [Internet]. [ανακτήθηκε 17 Οκτωβρίου 2026]. Διαθέσιμο από: https://dantelabs.com/el/genes/lias
AtlasΈνα τεστ. Απαντήσεις για όλη τη ζωή.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες