Gen
GABRA2
gamma-aminobutyric acid type A receptor subunit alpha2
- HGNC 4076↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000151834↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 2555↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 4p12
- Koordinater
- Kromosom 4: 46 243 548–46 390 128 (GRCh38)
- Exoner
- 10 exoner på 146,6 kb
- Protein
- 451 aminosyror
- MANE Select-transkript
- ENST00000381620.9NM_000807.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gabra2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs GABRA2, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Epilepsi (fullständig panel)
- Epilepsi
En av 171 gener kopplade till den
En hjärnsjukdom som kännetecknas av episoder med onormalt ökad neuronal urladdning, vilket ger övergående episoder av sensoriska eller motoriska neurologiska störningar eller psykiska störningar. Dessa episoder kan, men behöver inte, vara förknippade med medvetslöshet eller krampanfall.
- 3 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Så är GABRA2 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 8,5 kb av genens 146,6 kb, och 1 356 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av GABRA2
10
positioner i GABRA2 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller trolig patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsekvensering täcker alla 146,6 kb av GABRA2, inklusive introner, inte bara de 8,5 kb exoner.
ClinVar pathogenic variants (10)
The GABRA2 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 5
- Sannolikt patogen 5
| Variant | Conditions | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_000807.4(GABRA2):c.995C>T (p.Ala332Val) (opens in a new tab) | alcohol dependence and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000807.4(GABRA2):c.988_989insTTATG (p.Glu330fs) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 78 | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000807.4(GABRA2):c.923C>T (p.Ala308Val) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 78 | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000807.4(GABRA2):c.895A>C (p.Ser299Arg) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 78 | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000807.4(GABRA2):c.881C>T (p.Thr294Ile) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 78 | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000807.4(GABRA2):c.875C>T (p.Thr292Ile) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 78 | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000807.4(GABRA2):c.850G>T (p.Val284Leu) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 78 | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000807.4(GABRA2):c.787A>G (p.Met263Val) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 78 | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000807.4(GABRA2):c.644T>C (p.Leu215Ser) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 78 | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_000807.4(GABRA2):c.460C>G (p.Leu154Val) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 78 | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
Gener kopplade till samma tillstånd
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Delar 1 tillstånd
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseDelar 1 tillstånd
- ACTL6Bactin like 6BDelar 1 tillstånd
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Delar 1 tillstånd
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Delar 1 tillstånd
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDelar 1 tillstånd
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Delar 1 tillstånd
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Delar 1 tillstånd
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorDelar 1 tillstånd
- ARXaristaless related homeoboxDelar 1 tillstånd
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Delar 1 tillstånd
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till GABRA2
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som GABRA2 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the nervous system
- Chorea
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Poor eye contact
- Severe global developmental delay
- Encephalopathy
- Abnormality of coordination
- Autism spectrum disorder
Visa ytterligare 28 egenskaper
- Decreased reflex response
- Delayed speech and language development
- EEG with multifocal slow activity
- Intellectual disability
- Loss of developmental milestones
- Repeated seizures without recovery between them
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal gait
- Abnormal myelination
- Ataxia
- Attention deficit
- Autism
- Behavioral abnormality
- Brain degeneration
- Degeneration of cerebrum
- Diminished deep tendon reflex
- Disorder of involuntary muscle movements
- Hypsarrhythmia
- Impulsivity
- Involuntary movements
- Jerking
- Mental deterioration
- Tremor
- Unsteady walk
- Addictive alcohol use
- Cerebral palsy
- CNS hypomyelination
- Inability to walk
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-18: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.18-8b139e39.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). GABRA2-genen: gamma-aminobutyric acid type A receptor subunit alpha2. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/gabra2
Dante Labs. GABRA2-genen: gamma-aminobutyric acid type A receptor subunit alpha2 [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/gabra2
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor