Gen
FRMPD4
FERM and PDZ domain containing 4
- HGNC 29007↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000169933↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 9758↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- Xp22.2
- Koordinater
- Kromosom X: 12 138 473–12 724 523 (GRCh38)
- Exoner
- 17 exoner på 586,1 kb
- Protein
- 1 762 aminosyror
- Även känd som
- Preso1, Preso, KIAA0316
- Tidigare symboler
- PDZK10, PDZD10
- MANE Select-transkript
- ENST00000675598.1NM_001368397.1
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/frmpd4.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs FRMPD4, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Epilepsi (fullständig panel)
- X-kopplad komplex neuroutvecklingsstörning
En komplex neuroutvecklingsstörning som ärvs X-kopplat och kännetecknas av intellektuell funktionsnedsättning, autism och epilepsi.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 1 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Bredare grupperingar
Intellektuell funktionsnedsättning
En av 233 gener kopplade till den
- 4 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Så är FRMPD4 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 8,5 kb av genens 586,1 kb, och 5 289 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av FRMPD4
2Låg
Hur svår FRMPD4 är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av FRMPD4s exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.2,1 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.14 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
15
positioner i FRMPD4 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
Ett helgenomsekvensering täcker alla 586,1 kb av FRMPD4, inklusive introner, inte bara de 8,5 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Delar 2 tillstånd
- CLCN4Cl-/H+ antiporter 4Delar 2 tillstånd
- CNKSR2connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2Delar 2 tillstånd
- FTSJ1FtsJ RNA 2'-O-methyltransferase 1Delar 2 tillstånd
- GRIA3glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3Delar 2 tillstånd
- HNRNPH2heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2Delar 2 tillstånd
- IL1RAPL1interleukin 1 receptor accessory protein like 1Delar 2 tillstånd
- IQSEC2IQ motif and Sec7 domain ArfGEF 2Delar 2 tillstånd
- KDM5Clysine demethylase 5CDelar 2 tillstånd
- NEXMIFneurite extension and migration factorDelar 2 tillstånd
- PAK3p21 (RAC1) activated kinase 3Delar 2 tillstånd
- PCDH19protocadherin 19Delar 2 tillstånd
Egenskaper kopplade till FRMPD4
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som FRMPD4 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). FRMPD4-genen: FERM and PDZ domain containing 4. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/frmpd4
Dante Labs. FRMPD4-genen: FERM and PDZ domain containing 4 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/frmpd4
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor