Gene
SSX1
SSX family member 1
- HGNC 11335↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000126752↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 6756↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- Xp11.23
- Coordenadas
- Cromossoma X: 48 255 392–48 267 444 (GRCh38)
- Exões
- 8 exões ao longo de 12,1 kb
- Proteína
- 188 aminoácidos
- Também conhecido como
- CT5.1
- Transcrito MANE Select
- ENST00000376919.4NM_005635.4
- Tipo de locus
- gene with protein product
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
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Infertilidade masculina
A incapacidade de o homem fecundar um óvulo após um período determinado de relações sexuais sem proteção. A esterilidade masculina é uma infertilidade permanente.
- 1 submissor GenCC classifica-a como definitiva ou forte
Como SSX1 está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 1,2 kb dos 12,1 kb do gene; 567 dessas bases codificam a proteína.
Como um teste de genoma lê SSX1
1
posição em SSX1 onde a ClinVar classifica uma alteração como patogénica ou provavelmente patogénica
1 delas (100%) situa-se numa região onde as leituras curtas têm dificuldade.
- Segmental duplications (1 local)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Um genoma completo abrange todos os 12,1 kb de SSX1, incluindo os intrões, e não apenas os 1,2 kb de exões.
Genes associados às mesmas condições
- ACTL9actin like 9Partilha 1 condição
- ARMC2armadillo repeat containing 2Partilha 1 condição
- AURKCaurora kinase CPartilha 1 condição
- BCORL1BCL6 corepressor like 1Partilha 1 condição
- CFAP251cilia and flagella associated protein 251Partilha 1 condição
- CFAP43cilia and flagella associated protein 43Partilha 1 condição
- DMC1DNA meiotic recombinase 1Partilha 1 condição
- DMRT1doublesex and mab-3 related transcription factor 1Partilha 1 condição
- DNAH1dynein axonemal heavy chain 1Partilha 1 condição
- DNAH10dynein axonemal heavy chain 10Partilha 1 condição
- DNAH12dynein axonemal heavy chain 12Partilha 1 condição
- DNAH17dynein axonemal heavy chain 17Partilha 1 condição
Características associadas a SSX1
A Human Phenotype Ontology indica estas características como sinais das doenças raras que SSX1 pode causar. A página de cada característica lista os outros genes a ela associados.
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem esta informação
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- GenCC e ClinGen, publicado em 2026-10-16: as condições a que o gene está associado e o grau dessa associação.
- A lista ACMG de achados secundários, SF v3.2.
- ClinVar e as estratificações GIAB: locais conhecidos associados a doenças e as regiões que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
- Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
- Versão dos dados 2026.10.16-c6eea6bf.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene SSX1: SSX family member 1. Consultado em 17 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/ssx1
Dante Labs. Gene SSX1: SSX family member 1 [Internet]. [consultado em 17 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/ssx1
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