Gen
KCNT1
potassium sodium-activated channel subfamily T member 1
- HGNC 18865↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000107147↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 57582↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 9q34.3
- Koordinater
- Kromosom 9: 135 702 185–135 795 502 (GRCh38)
- Eksoner
- 31 eksoner over 93,3 kb
- Protein
- 1 235 aminosyrer
- Også kjent som
- KCa4.1, KIAA1422, SLACK, Slo2.2
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000371757.7NM_020822.3
- Lokustype
- gene with protein product
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
ReferansegenomGRCh38hg38
Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.
Les KCNT1 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Epilepsi (fullstendig panel)
- Epilepsi
Ett av 171 gener knyttet til den
En hjernesykdom preget av episoder med unormalt økt nevronal aktivitet som gir forbigående sanse- eller bevegelsesforstyrrelser eller psykiske forstyrrelser. Disse episodene kan være forbundet med bevissthetstap eller kramper, eller ikke.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Slik er KCNT1 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 7,1 kb av genets 93,3 kb, og 3 708 av disse basene koder for proteinet.
Slik leser en genetisk test KCNT1
55
posisjoner i KCNT1 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem faller i et område som korte avlesninger sliter med.
En helgenomsekvensering dekker alle 93,3 kb av KCNT1, inkludert introner, og ikke bare de 7,1 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Deler 1 tilstand
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseDeler 1 tilstand
- ACTL6Bactin like 6BDeler 1 tilstand
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Deler 1 tilstand
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Deler 1 tilstand
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDeler 1 tilstand
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Deler 1 tilstand
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Deler 1 tilstand
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorDeler 1 tilstand
- ARXaristaless related homeoboxDeler 1 tilstand
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Deler 1 tilstand
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Deler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til KCNT1
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene KCNT1 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the nervous system
- Brain degeneration
- Epileptic encephalopathy
- Focal motor seizure
- Generalized-onset motor seizure
- Interictal epileptiform activity
- Cognitive impairment
- Inability to walk
- Loss of developmental milestones
Vis 54 egenskaper til
- Multifocal epileptiform discharges
- Neurodevelopmental delay
- Nocturnal seizures
- Behavioral abnormality
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Degeneration of cerebrum
- Delayed CNS myelination
- Focal autonomic seizure
- Focal emotional seizure with laughing
- Focal hemiclonic seizure
- Focal impaired awareness seizure
- Focal tonic seizure
- Generalized tonic seizure
- Grand mal seizures
- Inability to walk by childhood/adolescence
- Intellectual disability
- Involuntary movements
- Myoclonic seizure
- Paroxysmal dystonia
- Profound global developmental delay
- Repetitive movements
- Thin corpus callosum
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Abnormal corpus callosum morphology
- Absent speech development
- Aggressive behavior
- Anxiety
- Delayed myelination
- Depression
- EEG with focal spikes
- Epileptic spasm
- Focal autonomic seizure with palpitations/tachycardia/bradycardia/asystole
- Focal clonic seizure
- Focal hyperkinetic seizure
- Generalized clonic seizure
- Hypsarrhythmia
- Increased theta frequency activity in EEG
- Personality disorder
- Poor eye contact
- Psychosis
- Repeated seizures without recovery between them
- Sleep walking
- Suicidal ideation
- Attention deficit
- Intellectual disability, mild
- NREM parasomnia
- Psychotic mentation
- Clonus
- Gliosis
- Increased reflexes
- Loss of brain cells
- Paralysis of all four limbs
- Seizure affecting one half of brain
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-16: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). KCNT1-genet: potassium sodium-activated channel subfamily T member 1. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/kcnt1
Dante Labs. KCNT1-genet: potassium sodium-activated channel subfamily T member 1 [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/kcnt1
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker