Gen
EIF2AK3
eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 3
- HGNC 3255↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000172071↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 9451↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 2p11.2
- Koordinater
- Kromosom 2: 88 556 741–88 627 464 (GRCh38)
- Eksoner
- 17 eksoner over 70,7 kb
- Protein
- 1 116 aminosyrer
- Også kjent som
- PEK, PERK
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000303236.9NM_004836.7
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/eif2ak3.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes EIF2AK3 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Ingen Genome Test-rapport leser EIF2AK3 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.
Slik er EIF2AK3 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 4,5 kb av genets 70,7 kb, og 3 351 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av EIF2AK3
2Lav
Hvor vanskelig EIF2AK3 er å sekvensere med korte leser, av 100Hver stolpe er andelen av EIF2AK3s eksonbaser i den typen vanskelige regioner. Poengsummen vekter dem etter hvor mye hver enkelt koster for et kortlest-kall: 0 når ingen base er i noen, 100 når hver base er i alle.
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, så et kall der kan mangle eller være feil. Vekt 35 %.0 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vekt 30 %.0 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser glir på og kanskje ikke spenner over. Vekt 15 %.3,4 %
- GC-innholdVinduer under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dekker tynt. Vekt 10 %.12 %
- ReferansedekningHull i referansesammenstillingen i nærheten, der det ikke finnes noen sekvens som leser kan justeres mot. Vekt 10 %.0 %
55
posisjoner i EIF2AK3 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem faller i et område som korte leser har vanskelig for å lese.
Et helt genom dekker alle 70,7 kb av EIF2AK3, inkludert introner, og ikke bare de 4,5 kb med eksoner.
Egenskaper knyttet til EIF2AK3
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene EIF2AK3 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Laboratory abnormality
- Insulin resistant diabetes
- Neonatal insulin-dependent diabetes mellitus
- High liver enzymes
- Low albumin
- Dehydration
- Fever
- High blood ammonia levels
- High blood bilirubin levels
Vis 3 egenskaper til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende steder, og regionene som korte leser finner vanskelige.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.17-8666dff2.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). EIF2AK3-genet: eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 3. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/eif2ak3
Dante Labs. EIF2AK3-genet: eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 3 [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/eif2ak3
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker