AtlasGen
RNU6ATAC
RNA, U6atac small nuclear
- HGNC 34017↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000221676↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 100151684↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 9q34.2
- Coördinaten
- Chromosoom 9: 134.164.439–134.164.564 (GRCh38)
- Exons
- 1 exon over 0,1 kb
- Ook bekend als
- RNU6ATAC1
- MANE Select-transcript
- ENST00000408749.1NR_023344.2
- Type locus
- Klein nucleair RNA (snRNA)
AtlasShare this page
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rnu6atac.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees RNU6ATAC en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Geen enkel Genome Test-rapport leest RNU6ATAC nog. De test leest uw volledige genoom uit, dus uw gegevens bevatten het toch.
Opbouw van RNU6ATAC
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 0,1 kb van de 0,1 kb van het gen.
Sequencing van RNU6ATAC
24Gemiddeld
Hoe moeilijk RNU6ATAC is te sequencen met korte reads, op een schaal van 100
0 · Makkelijk100 · Moeilijk
Sommige exonen van RNU6ATAC liggen op plaatsen waar korte reads een wijziging kunnen missen of verkeerd kunnen plaatsen.
Wat dit verergert: het aandeel van de exonen van RNU6ATAC in elk type moeilijke regio
- MapbaarheidStukken waar reads van 100 of 250 bp niet op één unieke plaats kunnen worden geplaatst, waardoor een call daar ontbrekend of onjuist kan zijn. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 100 krijgen.22%
- HomologieSegmentale duplicaties: kopieën elders in het genoom, zoals paralogen en pseudogenen, met 90% identiteit of meer. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 60 krijgen.0%
- Gedeeld met chrYDe pseudoautosomale regio's en de X-getransponeerde regio, waar chrX en chrY dezelfde of bijna dezelfde sequentie bevatten, zodat een read van de ene op de andere kan worden geplaatst. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 60 krijgen.0%
- ReferentiedekkingHiaten in de nabijgelegen referentie-assemblage, waar geen sequentie is waarop reads kunnen worden uitgelijnd. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 50 krijgen.0%
- HerhalingenTandemherhalingen en reeksen van één base, waarop reads kunnen verschuiven en die ze mogelijk niet overspannen. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 30 krijgen.8,7%
- GC-gehalteVensters met minder dan 25% of meer dan 65% G en C, die bij de bibliotheekvoorbereiding slechts dun worden gedekt. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 20 krijgen.0%
Een Dante Labs-score op basis van ons eigen onderzoek, gebouwd op de Genome in a Bottle-kaarten van NIST met moeilijk te sequencen regio's.Zo wordt er gescoordElke balk is het aandeel van de exonbasen van RNU6ATAC in dat type moeilijke regio. Elk type kan op zichzelf een gen moeilijk maken, en elk extra type voegt steeds minder toe: 0 wanneer geen enkele base in een moeilijke regio ligt, 100 wanneer elke base ligt waar reads niet op één unieke plaats kunnen worden geplaatst.
Kenmerken gekoppeld aan RNU6ATAC
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die RNU6ATAC kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the immune system
- Asthma
- Baby eczema
- Combined immunodeficiency
- Eczema
- Infection in blood stream
- Recurrent chest infections
- Recurrent pneumonia
- Recurrent sinus and lung infections
Toon 2 kenmerken meer
Abnormality of the digestive system
- Abdominal pain
- Chronic constipation
- Colonic eosinophilia
- Diarrhea
- Fat in feces
- Feeding difficulties
- Inability to properly digest food due to lack of pancreatic digestive enzymes
- Jaundice
Toon 1 kenmerk meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). RNU6ATAC-gen: RNA, U6atac small nuclear. Geraadpleegd op 21 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/rnu6atac
Dante Labs. RNU6ATAC-gen: RNA, U6atac small nuclear [Internet]. [geraadpleegd 21 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/rnu6atac
AtlasEén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken